曹興誠最初回應，他確實交付支票給沈君山，但未指定該款項必須捐給清大，並尊重沈君山安排使用。清大則表示，未查到該筆捐款紀錄。隨後，媒體人轉載前聯電總經理吳宏仁的說法，指出該筆款項可能由聯電支付，屬於合作項目，而非個人捐款，這才導致清大查無紀錄。
但這說法引發更大爭議。企業可以進行捐贈或產學合作，但若聯電確實以公司資源償還曹興誠的個人承諾，恐涉及背信與違法問題。核能流言終結者創辦人黃士修舉例，過去醒吾科技大學董事長曾以集團旗下高中名義開出支票，擔保個人4000萬元債務，最終被依背信罪判刑兩年定讞。黃士修呼籲檢調動起來，曹興誠是否真利用聯電資源支付該筆款項，因為這筆錢不應由聯電股東買單。
曹興誠近年形象大幅轉變，從紅頂商人變成反共大將，積極參與政治活動，並領銜國民黨立委徐巧芯罷免案。然而，近期不僅遭爆料有中國小三，現在又捲入清大1500萬元捐款風波，使其爭議不斷擴大。此案爭議點在於，曹興誠稱已交付支票，但沈君山2018年已逝，清大則強調沒有相關紀錄，如今又傳出「是聯電捐款」，不僅是把責任推給已逝的人，更引發外界質疑是否涉及將個人債轉嫁給企業股東。
若該筆款項確實由聯電支付，聯電股東有理由追問，為何要為曹興誠的個人承諾買單？此舉恐違反公司治理原則，甚至違法。若檢調介入調查並確認違法，曹興誠恐面臨法律責任，聯電則可能遭受財務與聲譽雙重衝擊，清大也在這場風波校譽受損，最終形成三輸局面。
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