據起訴指出，柯文哲為了角逐2024年總統大選，積極佈局且頻繁與財團、政商界人士接觸，並指示李文宗、李文娟兄妹共創木可公司、眾望基金會、新故鄉協會，負責管理其政治獻金。然而，柯文哲實質上卻利用木可公司，藉由肖像授權金名目、收受民眾政治捐款等方式，不法侵占政治獻金達6234萬餘元。
檢方指控，2024年1月13日，柯文哲於總統大選結束後，經邱復生提議合作經營網媒，並談妥由柯出資100萬元，作為創業投資。同年4、5間，柯先是和李文宗討論網媒的營利與投資，隨後指示李文娟與邱指定的聯絡窗口聯繫，並由李文宗先就國際電影公司背景進行調查，卻發現該公司有虧損、營運不佳且屬於個人公司等情況。
柯文哲在得知國際電影公司的營運狀況後，仍令李文娟自政治獻金專戶賸餘款中，匯款100萬元至國際電影公司帳戶，李再指示不知情的木可公司財務人員何璦廷進行匯款，以此方式侵占政治獻金賸餘款100萬元。
面對檢方指控，柯文哲於出庭時數度提到邱復生及該筆100萬元，包括去年起訴移審北院時曾稱「投資」，表示過去曾和邱討論利用媒體做黨的廣告文宣，並強調款項未超出選舉賸餘款使用範圍；今年9月，柯則稱之為「顧問費」，更斥責檢方不能因簡訊中寫到「創投」2字，就說這是投資，僅抓住1、2字便擴大解釋。
柯文哲也曾直言，若找邱復生做網站算公益侵占「後面開庭會很搞笑」，也稱「邱復生如果要做創投的話，至少要1億，他是媒體的大咖，怎麼會100萬在做創投呢？」對此，李文宗則曾表示，他只是被諮詢的對象，並不清楚後續有無採取行動，更沒有經手出金100萬元。
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