飛機失事的原因牽動後續龐大的保險賠償金額與究責議題。失事原因根據：鳥擊所致、航空公司維修不佳、駕駛疏失，天候因素、飛機設計問題，甚至是被飛彈擊落等不同原因，而會有不同的後續處理方式，或是究責對象。所以確定飛機失事原因茲事體大，必須由第三方的飛安專家根據俗稱「黑盒子」的飛行記錄器（Flight Recorder），以及各種跡證做出獨立鑑定。
路透社報導，濟州航空失事的這架波音737-800客機降落時顯然沒放下起落架，它以機腹在韓國務安國際機場著陸的時機，以及飛機或許是遭遇鳥擊的通報消息，這些情況都引起目前無法解答的疑問。
然而有專家表示，鳥擊似乎不太可能造成起落架故障。
中央社報導，曾任航空評鑑網站AirlineRatings.com總編輯的湯瑪斯（Geoffrey Thomas）說道：「鳥擊並不罕見，起落架出問題也不稀罕。鳥擊發生頻率遠高得多，但本身通常不會導致飛機毀損。」
澳洲航空安全專家戴爾（Geoffrey Dell）談到：「我從未見過鳥擊造成起落架無法放下。」
戴爾還說，若有鳥群被吸進CFM國際公司（CFM International）製造的發動機，鳥擊可能會影響飛機，但不會直接讓發動機關閉，機師因此能有一些時間應對此狀況。
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