全國教師會關注到國中小校長與主任的任用規定，主要的意見是希望比照高中的方式，取消需經過甄選儲訓的規定，主任由校長直接任用，校長則可以直接參加遴選。國中小目前的主任本來就有許多沒有任用資格的老師擔任，重點是有資格的主任以後才能取得校長遴選的條件。
所以問題還是在於各縣市舉辦的校長遴選，如何選拔合適的人才，成為帶領校務發展的領頭羊，才是國民教育法該修正的核心內容。因為只要有公平公正公開的校長遴選制度，沒有透過甄選儲訓的過程，已經無關輕重了。
目前各縣市國中小校長遴選的問題包括「官方意見強力主導」失去校長遴選的整體性與客觀性的評選；「遴選過程主觀性過大」欠缺提供給遴選委員的充分資料與評選標準；「遴選委員代表性不足」造成無法為學校選拔出適宜勝任的校長人選。
近年來在各縣市的校長遴選發生的一些現象，包括有的學校家長和老師認為校長辦學不力，地方政府的遴選卻還是強力運作讓校長連任；有的縣市根本沒有落實遴選，都只是長官的口袋名單，造成關係比辦學重要的傳言。
要解決這些問題，還是要從法規擬訂出校長遴選能夠符合公平公正公開的原則：
1.建議將遴選委員人數與代表性入法，不要讓地方政府有運作的空間。應該涵蓋「學界」、「教師」、「家長」、「校長」與「官方」各占五分之一，而且要由出缺學校的家長和教師代表擔任遴選委員。
2.地方政府辦理校長遴選應該要有階段性，現任先遴選完畢再辦理新任的遴選，不該便宜行事一次遴選會議就辦理完畢。這部分也應該在法規上具體列出，讓校長遴選得到更多的社會信任。
3.為了讓遴選委員的評選有依據，而不是只憑個人主觀意見，應該擬訂出評選項目，並依此評分。建議可涵蓋參與遴選人的「學經歷」、遴選人在學校的「辦學績效」、「社會觀感」、「學生表現」與「領導統御」等具體內容。最後可加入遴選委員個人的加分項目，但也應該具體說明。
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