卓榮泰25日率相關部會首長到立法院進行「台美關稅談判之進程、方針、原則及台灣產業可能遭受之衝擊影響評估 」專案報告並備質詢。
國民黨立委賴士葆質詢時詢問，邱泰源是否跟卓榮泰見面？邱泰源回應「有」，但卓榮泰沒有要求寫辭職信。卓榮泰則說，他跟邱泰源見面時，「問他你對於未來的工作有沒有什麼長遠的計劃？他跟我講了很多過去做的事、未來要做的事。」
賴士葆質疑，但媒體大篇幅報導稱卓榮泰要邱泰源請辭，結果邱泰源不要？卓榮泰回應，「我跟邱部長見面只有我們兩個人，沒有任何媒體在現場。」賴追問邱泰源，卓榮泰到底有沒有要你請辭？邱泰源說「沒有」，兩人都是談工作計劃及「健康台灣」推動狀況。
賴士葆直言，因為從這件事看，他覺得數發部長黃彥男、經濟部長郭智輝的請辭都是「被請辭」，「完全是由上而下，我要你走，只是讓你說健康因素、生涯規劃等，比較好看。」對此，卓榮泰指出，黃彥男是借調到8月底，回歸中研院，郭智輝更有其他個人因素。
最後，賴士葆再問邱泰源，「在立院備詢要講實話，確實沒要你寫辭職信？」邱說，「確實沒有」。
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