《鏡週刊》9月爆料高虹安博士論文抄襲、侵權疑雲，高虹安立即召開記者會反擊，當場還以流利英文唸出論文架構，並秀出美國辛辛那提大學回函聲明，這波高能操作讓不少人激賞，不過記者會上一番想酸新竹市前市長林智堅的言論：「不是像什麼中華大學夜間部，才要去做台大碩士灌水」卻意外發酵。
正巧也是中華大學校友的國民黨候選人林耕仁，批她「瞧不起人」，民進黨候選人沈慧虹更訴之感性，想起沒機會讀書、被無情嘲笑的媽媽，雖高虹安立即向中華大學致歉，但仍阻止不了輿論海嘯，不少網友紛紛群起撻伐大喊「歧視」，當晚（9月20日）「高虹安」3字也飆上Google熱搜關鍵字榜首，超過20萬筆搜尋，聲勢雖漲一波，但也被貼上傲慢、自負的標籤。
全黨打一人 綠營不惜動用國家機器
論文風波未息，立委柯建銘接力成綠營主力打手，除高聲批評高虹安任職資策會期間未經報備兼職，且論文涉及侵權等，甚至資策會也走法律途徑對高虹安提告。但高虹安也召開記者會反擊，並拿出過去與資策會主管內部郵件證明，同時也批評資策會執行長卓政宏在國會公然說謊。綠營這波操作不但塑造高虹安被害人形象，也讓學者批評「動用國家機器」，地方人士也認為反而催出「討厭民進黨選票」。
但爭議還未結束，林耕仁突然加入戰局，針對高虹安也提出5項質疑，包括第一、任用男友擔任立院公費助理；第二、購得科智股票時，早已知悉鴻海將投資科智企業，涉嫌內線交易；第三、涉及違法將資策會所屬專利權讓與他人，第四、至今拿不出資策會線上核准的兼職的紀錄，第五、任用涉多起刑案訴訟的袁姓助理等。
林耕仁加入戰局打高 名嘴跟著火上來加油
高虹安隔天也一一拆招反擊，提及內線交易部分，還不忘諷刺林耕仁「股票還沒上市何來內線交易」，更批他對產業、科技企業的基本ABC都不了解，卻加入綠營抹黑隊伍，難道希望綠營在他的助攻後繼續維持政權，放縱他的「灰色事業」？更以「沒有當選機率」、「當選機率極低」來形容民調低迷的林耕仁。
而私領域被公開部份，高虹安並未向外界證實前助理李忠庭是自己男友，面對名嘴周玉蔻影射的「小三」說，更是選擇以訟止謗，昨天（3日）凌晨李忠庭也公開聲明，強調是結束婚姻後才認識高虹安，且擔任公費助理期間都有履行職務。至於被指「國庫通黨庫」，助理費成政治獻金「回流」爭議，高虹安昨天（3日）接受聯訪時，也點出綠營大佬柯建銘、蘇嘉全也都有這樣的狀況，且捐贈金額還不小，藉此證明該金流在立院很常見且並無違法。
先打林智堅再打林耕仁 竟都是香山在地政治人物
談及高虹安面對爭議的態度和回應，地方人士指出，從一開始論文爭議，高虹安自稱是斐陶斐、才不是什麼中華大學夜間部時，新竹市就有很多藍、綠議員服務處接到民眾電話大表不滿，認為高虹安的言論明顯歧視學識不高的群眾。
高虹安近期攻擊競爭對手民調低、沒有經營基層等言論，也引發藍營基層反彈。地方人士分析，以林智堅和林耕仁為例，兩位都是香山出身的在地政治人物，一位是兩屆市長，一位是六連霸的議員，在地實力與成績都並非空降新竹市來參選的高虹安可以相比擬。
地方人士也點出，竹科相當多的從業人員，論學歷和學識也都比高虹安更加淵博，這群人有些是中高階主管、有些是研發單位；他們求學期間、甚至是工作環境都與相當多優秀的同儕共事，這群人的特性是謙遜低調，縣市首長之於他們是服務者，而非高高在上的政府官員。
地方人士認為，如果太過驕傲又目中無人，也都不會是理想中的公僕角色，高虹安近期脫序的言論顯露出自身的傲慢，這點無論對基層民眾或是竹科從業者都犯了選舉大忌。
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