甫開庭，檢察官林俊廷首先就直攻行動硬碟「A1-37」。林提問，「A1-37」是何人的行動硬碟？柯文哲表示，該硬碟從他家中搜出查扣「應該是他的」，硬碟上頭所貼的字條也是他的字跡，但對於該硬碟他毫無印象，應是當初作為備份用途使用；至於檔案內存有幾萬個檔案，究竟是從何時起備份的他並不清楚。
然而，柯文哲在接受檢察官詰問時也頻頻抱怨，稱檢方查扣他的行動硬碟卻沒證據，而是用硬碟裡面的資料編故事，「你們敢辦鏡新聞嗎？罵你們唾面自乾還真的唾面自乾⋯」。柯自稱是「檔案狂」，對於硬碟內很多檔案他都「不記得了」，甚至自爆已向陳佩琪確認過，家裡完全沒有任何金流。
順著硬碟內容，林俊廷也追問存放於其中的Excel檔案「工作簿」，柯文哲稱對於「工作簿」內容沒印象，自己也是在關押期間才看到，上頭記載的人物不見得都認識，並稱最認識的就是「邱佩琳」。只見林接續提問柯，過去與會計師范有偉、基隆市長謝國樑母親、信義房屋創辦人周俊吉妻子等人是否曾有過金錢來往？柯則數次表明「拒絕回答」。
不過，柯文哲也在與林俊廷幾次攻防後，透露一些訊息。例如范有偉證稱，有在家中地下室拿500萬元給柯，柯回稱「這是我們之間的事，他會幫忙我，但我拒絕回答」；另外，負責替周俊吉妻子募款的邱佩琳也證稱，她有將周妻捐助的200萬裝在袋內並請柯派人來拿，柯則回稱「不清楚」，直言就算現在把他抓去測謊，也還是想不起來。
其中，針對博奕教父陳盈助機要邱清章，曾前去柯文哲辦公室面交300萬元現金，柯表示當時募款PM為競總主任周芳如，因此他從邱拿到錢過了1、2天後，便隨即轉交給周。對於這筆300萬元捐款，柯坦言是看到邱作證時才想起來；檢方也追問，周曾證稱是由柯隨行秘書許芷瑜經手轉交，柯證稱「是對的啦！但沒有印象」。
為了追出「工作簿」由何人所做，林俊廷質疑，除了柯文哲之外，還有誰可以知道該筆資金來源是陳盈助？柯則回稱不知道；林再詢問，是否有用過帳戶「wen」製作過檔案？柯也稱不清楚。似乎是難忍情緒，柯此時也再痛斥「總有一天，也要去抄民進黨中央黨部，看民進黨帳冊經不經得起考驗」。
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