2022年8月，一名年輕女業務指控鄭醫師於同年6月邀她到台北市松山路的丼屋餐廳吃晚餐，但卻趁她喝酒後意識不清，帶到林森北路的薇閣精品汽車旅館性侵，女業務表示，她依稀記得在迷糊狀態時，專長婦科的鄭醫師對她說：「妳月經是第3天。」接著又問：「可以射嗎？」後來她昏睡過去，起床驚見全身赤裸，懷疑被鄭男性侵，憤而提告。
指女業務自稱「月經第3天」
但鄭醫師喊冤說當時他頭暈，躺在床上睡著，過程中感覺生殖器被撫摸，甚至被含住吞吐，後來發現女業務騎在他身上，他一直表示這是不安全性行為，但她卻說：「月經第3天，不用擔心。」
檢方調閱監視器，發現2人從餐廳離開後，一同搭計程車前往摩鐵，女業務並無意識不清，載送2人的計程車運將也證稱，當天女業務沒有被鄭男攙扶，上車後雙方還有交談，女方還告訴他「走錦州街」去薇閣比較快。
不僅如此，檢方勘驗手機，查出女業務在事發後回到家，還傳訊給鄭男：「老爹我到家了，謝謝老爹照顧我。」之後也像往常一樣，傳送早安圖給醫師，檢察官認為遭性侵害的被害人，通常會拒絕與加害人聯繫，但女業務卻反應不同，加上欠缺性侵證據，將鄭醫師不起訴，女業務不滿聲請再議，高檢發回續查，北檢重啟調查後，仍不起訴確定。
已遭台大醫院解聘
不過，去年3月立委范雲召開記者會，指控鄭醫師另對多名女子下藥性侵，有3名受害女子現身記者會，
控訴鄭醫師假借工作名義邀約用餐，趁機下藥性侵。
台北地檢署昨指揮警方到鄭醫師住家等地搜索，並約談他到案說明，訊後依涉犯強制性交等罪，諭令40萬元交保。
此外，台大醫院去年6月對鄭醫師進行倫理調查，認定他違反醫師倫理規範、醫界倫理紀律宣言，違背專業醫師形象、職業道德及社會大眾對醫師的期待，去年底解除他的醫師職務。
鄭醫師也在台大醫學院任教，去年被爆性侵3女後，被校方停聘教職，台大性騷擾防治委員啟動調查，今年一月認為「缺乏充分證據」，決議性騷擾不成立，並將召開台大校教評會，討論鄭醫師提出的復聘案。
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