衛福部召集外聘專家學者成立調查小組進行調查，認定保護司、社工司及長照司共有3名簡任非主管被認定有霸凌行為，包括對下屬大聲咆哮、不合理退回公文等，嚴重影響同仁工作。考績會根據相關規定，決定對這3名主管分別給予1大過、1小過和1大過的處分，其中情節嚴重者已調離現職，並將持續追蹤改善情況。
此外，長照司長被指控要求同仁每日做健康操與深蹲運動，雖非霸凌行為，但確實造成部分人員壓力，加上媒體報導後，司長要求同仁「支持他」，引發公正調查疑慮。調查小組認為此事有不當之處，決議給予司長1小過處分。
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針對其他主管，包括社保司長被指曾用「不當比喻」造成員工心理壓力，雖未構成霸凌，但影響工作氛圍，考績會給予申誡2次，並解除其主管職務。此外，社工司與保護司兩位司長未能有效制止霸凌事件，均被記申誡1次。不過，健保署及國會組等被投訴的案件，經調查皆未發現證據，霸凌指控不成立。
呂建德強調，衛福部已全面檢討防止霸凌的相關規定，並根據調查結果著手改善人力吃緊的問題，特別是國會組業務量過重，已迅速核准增加人力。他也提到，隨著業務量因疫情、公共衛生及長照需求大幅成長，工作壓力加劇，未來將加強主管的情緒管理與同理心訓練，提供課程幫助主管有效溝通，營造更友善、安全的工作環境。
