中央流行疫情指揮中心指揮官王必勝9月29日宣布，外國旅客來台後，若行程中確診，需入住集中檢疫所或地方政府的加強型防疫旅館，相關隔離與就醫治療費用「由我國承擔」。但交通部觀光局昨(9/30)公布「旅行業辦理入、出境團體旅遊操作指引」，旅客入境快篩染疫，卻要自付醫療費用。
薛瑞元今早表示，今年10月13日起實施入境檢疫0+7，不過估計外國觀光客不會那麼快來台，開放初期大部分是國人返台探親或工作，這批回台國人境外移入確診，不宜跟本土確診差別待遇，所以邊境解封初期，治療均以公費處理，待開放一段時間後，已有很多外國觀光客入境，可能就會調整政策。
如果在國外確診新冠肺炎，必須在當地待滿7天才能搭機返台，旅遊業者指出，這可能造成團客染疫卻隱匿不報，如何防止這類情事發生？薛瑞元說明，國外缺乏嚴格的追蹤監視機制，所以重點在於旅客是否符合入境條件，抵達國門時仍須遵守我國防疫規定。
薛瑞元也說，現沒有要求提供登機前PCR檢驗陰性報告，是否在國外染疫且發病7天後才登機，這很難查證，但入境後要做快篩，目前採取這種做法。
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