總協調官行政院政務委員季連成表示，統計死亡人數19人、失聯人數5人、救出人數717人、受傷157人。季連成說明，災防過程分為三個階段，第一階段是「防災」，這必須全年無休持續進行，尤其臺灣地處天災頻繁的地理環境，防災工作不應有任何鬆懈，每日都應做好防災準備，每年各縣市也都會執行防災演習，確保應變能力。當天災發生時，則進入第二階段「災害救援」，包括國軍部隊、志工、救災同仁等將投入救災。最後，當災害救援階段告一段落後，則進入到第三階段「重建復原」，此階段歷程較為漫長，包含農田復育需耗時2至3年，同時災民安置、興建組合屋等亦需較久時間。
有關堰塞湖監控情況，季連成指出，目前堰塞湖仍維持紅色警戒，要解除紅色警戒，必須符合四項條件：第一，堰塞湖目前水深約20公尺，蓄水量155萬噸，為溢流前原有水量的1.7%，平均每日水流量為50至100萬噸，不足形成威脅；第二，目前2,860公尺堤防修築工程已趨完成，正加強鞏固中；第三，馬太鞍溪疏浚已完成12.8萬立方公噸，後續將持續推進至明年。
季連成進一步表示，第四項條件為疏散撤離應變計畫，昨日上午11時已與花蓮縣政府針對疏散撤離應變計畫做最後一次討論，大致定案，但縣府仍有部分細節尚待確認，後續兵棋推演時間將尊重縣府安排，中央會協助縣府檢視其疏散撤離應變計畫是否需調整改進，透過兵棋推演與實兵演練有助於驗證計畫。而上述四條件皆達成後，將研判紅色警戒下調至黃色警戒或更低。
災民收容情形方面，季連成指出，大進國小僅剩1名收容災民，學校空間將可全面恢復教學使用。此外，光復商工今日也恢復實體上課，而能如此迅速復課，是中央前進協調所、教育部及花蓮縣政府等同仁一起努力的成果。季連成說，雖然學生已復課，但兩校校區內，仍有部分工區有待重新整建；為使學生學習與重建工程互不干擾，已嚴格採取學生與工程人員分流的實體區隔。
季連成說明，目前工作重點在於側溝清理，也是志工主要協助工作項目，而側溝清理長度已達21.6公里，預計於10月15日全數清理完畢。他也要求內政部國土管理署以專人專責方式認養地下水道，務必在15日前將地下水道打通，確保排水系統順暢運作。此外，另一項工作重點為佛祖街清淤，首要任務為打通林田幹道（佛祖街46巷），目前尚餘約800公尺即可打通；林田幹道打通後，沉澱於農田中的家屋就能進行清理，也能打通排水溝及灌溉系統。
教育部鄭英耀部長表示，在馬太鞍堰塞湖溢流後，他於9月25日即來到花蓮縣光復鄉視察，看到學校受到嚴重傷害，包括光復國中足球場淤沙達1.5公尺高，當時預估需要至少大卡車1,000車次以上才能清運完成。鄭部長說，在季總協調官指示下，優先復原教學區，確保學生受教權益不受影響；短短2週多時間，學校教學區即復原完成，也能看見足球場部分綠色草皮露出。而光復鄉各校今日已全數恢復實體教學、正常運作，學生到課率也逐步達成復原復課目標，令人感動。
鄭英耀指出，下一階段重點是學校活動區災後重建，感謝東華大學提供運動場域與設施，使光復國中體育班學生維持正常教學與訓練，同時也感謝慈濟大學盤點校舍空間，隨時支援光復地區中小學的教學需要。目前中小學已能在校內實體上課，不再需要借用大學場地，再次感謝來自民間各界力量給予學校的支持，讓學生能迅速返校上課。
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