預算中心指出，民國90年至115年度特別預算舉借債務數達3.4兆元，高於同期間總預算舉借數，爰以特別條例排除債務流量管制，恐加速公共債務攀升，對財政紀律等相關規範之鬆綁允宜審慎，俾維財政健全；截至114年8月底止，中央政府一年以上公共債務未償餘額為5兆8,379億元，在不增加債務之前提，按115年度債務還本預算數1,265億元計算，需逾46年始能清償，允宜審慎研謀改進。
預算中心直指，近次特別預算財源多屬公債及賒借收入，其以非經常性財源充當經常支出之整體比例逾五成，容有加重後代債務負擔之隱憂，允宜預為規劃償債財源，俾益財政健全。
預算中心坦言，近16年中央政府歲入歲出加計特別預(決)算後多呈差短，近5年度則波動加劇，面對國際經貿不確定性風險，允宜進行多元情境之歲入歲出推估，俾利掌握衝擊程度，並彈性配置資源；115年度中央政府總預算案歲出規模創新高，又近年總預算連同特別預算之歲入歲出均呈現差短，允宜審慎因應並重視賦稅負擔率對政府財政之影響，以利財政健全發展。
預算中心報告還稱，近年債務舉借決算數未予公布，且部分特別預算執行多年未完竣致債務舉借保留數未註銷、或於後續數年陸續註銷，造成債務餘額預、決算數差距頗大，允宜檢討改善以提升債務透明度。
預算中心表示，政府屢以特別預算進行政策支出彈性調整，總預算、決算僅為形式平衡，如今年度即同時執行中央政府前瞻基礎建設計畫第5期特別預算、新式戰機採購特別預算、中央政府海空戰力提升計畫採購特別預算、中央政府疫後強化經濟與社會韌性及全民共享經濟成果特別預算、丹娜絲颱風及728豪雨災後復原重建特別預算與因應國際情勢強化經濟社會及民生國安韌性特別預算案等6項特別預算；併計特別預算後，近16年度中有12個年度呈現差短現象，2022至2026近5年度，歲計餘絀則波動加劇，且2026年度預計差短將擴大至2735億元，難謂穩定良善。
預算中心強調，115年度國防部主管單位預算案雖再創新高，惟未依法律規定編足志願役加給，不符合依法行政原則；另其占該年度中央政府總預算案歲出比率18.5%為近年新高，且未來年度仍恐持續增長，行政院允宜注意對其他政事經費需求之排擠。另，新式戰機採購特別預算執行期程將於115年度屆滿，然首2架戰機出廠均較原規劃期程延後，為利我國能於規劃期程內取得所需戰機，國防部允宜積極與美方協調，並精進財務管理效能。
