全案源於2022年底至2023年初，全台因國內雞蛋供應不足引爆蛋荒。據監院調查報告指出，由於畜產會缺乏海外買蛋經驗，先前僅於2019年辦理過雞蛋緊急調度，透過聯繫日方代理商吳諭非協助採購日本雞蛋，因而在2022年同樣找上吳女簽約進口日本雞蛋，並在下半年改以「現貨購買」模式，向超思公司採購16批、2500萬顆日本雞蛋。
監察院發現，畜產會隨後在2023年巴西雞蛋進口專案中，不僅未依規定要求超思公司在採購錢先行報價，導致失去評估蛋價主動權，且於採購進口雞蛋時，也無相關價格查核機制。此外，畜產會竟容許超思先行墊付進口雞蛋貨款，並於付款後、交貨前，以代墊貨款單據請款，種種行為皆不服合約規定。
監察院指出，農業部委托畜產會辦理專案進口雞蛋，在2023年大量進口超過1億5000萬顆雞蛋，卻未掌握民間企業自行進口的數量，也未注意當時國內雞蛋產量逐漸回穩，導致同年7月首次出現庫存逾期55萬餘顆雞蛋，直至同年9月已累計達5429萬餘顆逾期雞蛋，後續再論倉儲、銷毀等費用，總計損失就達5億2997萬元，更不用說期間因雞蛋存放不周、改做成蛋液等，所衍生的產地標示疑慮及食安風暴。
台北地檢署獲報偵辦，今日偵查終結。檢方調查發現，吳諭非與超思公司涉嫌高報蛋價，並勾結時任畜產會專員吳俊達，向中央畜產會詐領共計6085萬1457元雞蛋貨款，依刑法詐欺取財、行使業務登載不實文書、違反洗錢防制法等罪嫌起訴秦語喬、吳諭非及吳俊達共3人，並對吳諭非求刑2年。
此外，北檢也分他字案偵辦農業部、畜產會高層，被告包括農業部前部長陳吉仲、中央畜產會前董事長林聰賢、農業部長陳駿季、畜牧司前司長張經緯、副司長李宜謙等5人。案經近2年偵辦，檢方認定陳吉仲等人查無不法，今日予以簽結。
檢方指出，陳吉仲作為決策者，後續相關採購細節交由畜產會執行，尚無證據認定陳吉仲就超思公司進口雞蛋的條件、請款流程有何具體指示；另陳駿季雖為時任農業部政次，但進口雞蛋計畫是由張經緯主責，且均曾透過各個管道尋求海外蛋源，並非單獨挑選超思公司，尚無積極證據可證明有合謀詐欺情事。
檢方說明，另審酌農業部畜牧司的採購雞蛋簽呈皆未見李宜謙的署名或簽核，未對雞蛋進口事務有何具體職務行為，林聰賢也僅負責對外與產業界溝通，實際採購細節皆由畜產會處理，況且經查5名被告帳戶皆未發現有異常金流，因此認定陳吉仲等人未涉有瀆職、圖利等犯行。
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