對於被檢方指控收賄、圖利，柯文哲反控，「這段時間被檢察官抹黑、抹紅、抹黃，但內心坦蕩」，他還說，當外科醫生30年從未收過紅包，京華城案一切公開透明，他身為醫生，醫學知識很專業，但哪什麼都懂，市政就是如此， 並強調京華城容積率不是他一個人能決定。
柯文哲還說，市長有9印章，只有一個是由市長保管，其餘由副市長、秘書長、副秘書長等人保管蓋章，請檢方不要有太多幻想，此外，還好有苗博雅曾在議會質詢他，當時質詢的影片是最大保障，因為從影片中可看得出他對容積率並不清楚，是檢察官有罪推定、羅織罪名。
柯文哲拿著事先寫好的稿子繼續說，去年9月我被收押，前4個月我連抗告都沒有，我自認坦蕩，就讓你們(檢察官)去調查，應該很快就會澄清，結果竟然被收押禁見到現在。一直到起訴之後，讀了起訴書，還有這3個月在獄中看了很多筆錄，才有機會以其他角度檢視京華城案，才恍然大悟，原來檢方是有罪推定，已有既定立場，根本在羅織罪名而已；配合特定媒體，一搭一唱的抹黑。
柯文哲接著說，京華城和議員有金流他不知道，而金流發生的時間是在容積率通過之後，當時我們更不會知道，相信除了當事人，也沒人知道，而且金流的事，和我們也無關。我就明白講，台智光案有議員被收押，但有哪個公務員被押？議員給公務員壓力，也沒人向他報告，以市府晨會制度，遇到困難，不好解決的，就去晨會掛號，安排時間來報告，我們就會討論，也會有會議記錄。台智光案、北士科案，晨會報告都有3次以上，我們也都有正式的會議記錄。
柯文哲強調，長官每天要應付的事情很多，所以只處理三種事情，緊急、例外、訂規則，他沒參與容積率的決定是真的，到目前為止，沒有任何人說他去指示京華城，所以檢方只好羅織罪名，起訴書中提到他指示市長室秘書打電話、傳LINE訊息給公務員施壓本案，「我絕對沒有指示市長室秘書去對公務員做京華城有關的指示，因為我根本沒管本案，也不知道其進行情況，當然不可能有指示」，檢方傳一大堆證人，唯獨此事不調查，故意要抹黑他參與本案。
此時，柯文哲質疑，本案所有認罪的人都是檢察官林俊言訊問的，因林俊言也是用威脅、罷凌的方式對待他，「他訊問我的時候，說我的USB有不雅影片，如果我不承認的話，就要交給法院，就會公開給社會大眾，對我不好。如果我承認的話，他可以把影片拿掉不交給法院。我還差點被唬住，想說是不是我被關太久，已經失憶了，哪裡來的不雅影片？還好我們家陳佩琪家教森嚴，所以不可能會有。」此時，現場旁聽民眾一陣大笑。
柯文哲稍早一度情緒上來怒嗆檢「我恨死你們了！」，後來繼續說到黨、檢、媒一條龍的政治迫害，說著說著情緒又上來，這次直接怒罵檢察官「不要臉！」讓台灣不再相信司法。此時被法官制止，並詢問是否要暫時休息，但柯表示會控制情緒要繼續說。
柯文哲隨即說，他收押7個月雖失去空間，但換來許多時間，他10年前棄醫從政，每天要應付太多事，但不一定每件都做得好。此時，柯文哲他突然想到父親生病過世期間，無法親自照顧，柯突然哽咽爆哭失聲數分鐘後，他平復心情繼續說，無法陪父親最後一程，當得知父親過世的一瞬間一生的遺憾、一輩子的痛，「我要怎麼原諒你們！」
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