邱仲峯解釋，目前世界已經有108部質子治療設備運作中，全世界接受質子治療的患者數也突破式的上漲，台灣則有12間醫療院所申請建置質子治療設備並得到核可，美國放射腫瘤協會則公布雙側乳癌、有心肺疾病、第二次放射治療等適應症，符合者可申請保險，且適應症內容還在逐步增加當中。
針對北醫附醫現況，邱仲峯說，針對年輕、40歲左右，病變發生於左側，有心肺疾病的患者，會主動告知有質子治療此一選項，每個病患都會跑過質子治療與光子治療後的預測圖，可以明顯比對出差異性，讓病患有其選擇依據，心臟劑量可降低85%、對側乳房劑量降低85%、肺部劑量降低50%。
至於未來質子治療是否有機會納入健保，邱仲峯說，對此衛福部監督委員會已提出相關提議，但衛福部表示，未來會支應，但要等更普及化，否則只有少數幾間醫院受益，而衛福部有委託放射腫瘤學會製作5年白皮書，他推測五年白皮書走完可能就是時候了，近期希望先將質子治療的健保給付提供給兒童，推估一年需付出新台幣2.5億元，也認為政府應該出得起這個錢。
對此健保署長石崇良表示，目前尚未接到來自學會的建議案，而各項治療方式納入健保有其一定的程序，首先需要經過醫療科技評估（HTA），確認其適應症、應用人數等資訊，尤其質子治療適用的癌種眾多，另需確認治療方式是否比傳統是否帶來更多效益，並進行財務衝擊評估，後送入專家會議討論、召開共擬會議進行決策。
不過，石崇良也提到，雖然目前有12間醫療院所提出質子設備申請並得到核准，但實際有在運作、或即將上線的僅有高雄長庚、林口長庚、北醫附醫、台大醫院等，其他醫療院所則可能在規劃或建制階段，因此還要考慮治療普及性問題，不能說只有一兩家能做，導致所有病人都要擠到特定醫院，產生醫療不平等的情況。
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