台大國發所先前接連爆發前新竹市長林智堅、前桃園市長鄭文燦論文抄襲案，碩士學位慘遭「雙殺」，而這也重創台大校譽及學術權威。
針對接下來台大要如何因應這個「大問題」，陳文章指出，台大未來會有幾個方面來做，第一，未來如果有學倫問題，導致碩博士論文「被撤銷」，就會啟動主動檢核機制，針對老師、系所做主動評鑑，在3月教務會議後開始做，因爲各個學院性質不同，會請各學院訂定論文審查標準，論文應該是要看原創性、結果等，除了論文引用，也會請學院訂相關標準因應。
陳文章也說，除了啟動主定檢核機制外，校方也要教導學生怎麼研究並寫論文，接下來各個學院會開設教導如何研究、寫論文等相關課程。
另國發所未來是否會停招，陳文章則說，國發所及人文社會學院，都要做相關會議，才能做最終發布，請大家耐心等待一下，並強調，只要台大以後有碩博士論文被撤銷學位，可以有主動評鑑制度，因為現在是5年評鑑一次，以後會主動協助評鑑，這是上任後必須做，但這樣機制必須經過教務會議同意，已經提出這樣構想，但仍要等教務會議討論結果。
至於陳明通的相關調查，陳文章說，關於學生論文檢核及老師的檢核是不同機制，外界質疑對老師檢討速度較慢，是因為有相關程序要跑，學倫案調查根據教育部規定是要保密，等有結論就會跟社會報告。
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