根據台灣票據交換所票信查詢服務，截至去年12月8日，王長怡及個人投資公司共有5筆退票記錄，總金額達1320萬元，退票理由都是「存款不足」。同時新竹地院陸續收到向聯亞生技集團的聯合生物製藥公司追債案件，分別是請求給付貨款、支付命令、給付價金等案件，金額不高卻鬧上法院，部分已和解。
根據經濟部公司登記資料，王長怡投資公司資本額200萬元，代表人王長怡持有完全股份。王長怡個人的1筆退票紀錄有清償註記，王長怡投資公司4筆退票紀錄沒有清償註記。王長怡對此曾發聲明表示，台灣金融騙子不少，導致負擔高額利息且無法處理資產，因此採取「支票退補」與「提出訴訟來止血」。
根據公告資訊，聯亞生技自2023年2月陸續處分持有之聯亞藥股票，約原持股之22%。王長怡宣稱，基於聯亞生技及子公司的財務需求，截至去年底依董事會決議出售約7000張聯亞藥股票，以利現金周轉。但有股東質疑，是否有合法的董事會議紀錄？
至於質押聯生藥股票部分，UBI TW HOLDINGS, LLC.（美商聯合生物醫學台灣控股公司）在去年8月，委託伯衡法律事務所發函給金管會、證券商同業公會、證券櫃檯買賣中心，請主管機關負起積極監督金融市場之責，發函責成全國證券商不得協助王長怡將該公司持有的股票設定質押。
王長怡表示，確曾代表公司向統一證券確認集團公司間雙方以借股取息及質押貸款的可行性，但這是在董事會同意與授權活用聯亞藥股票的原則下，且後來經綜合考量，王長怡投資公司未執行此借股質押貸款方案。不過股東質疑王長怡仍未說明，為何先前會以私人投資公司作為進行借款的理由，且質疑董事會不知道、也沒同意此事。
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