國安會現任三名副祕書長分別為陳文政、徐斯儉及劉得金，其中陳文政即將退休，現任總統府副秘書長黃重諺曾一度傳出出任副秘書長或諮詢委員。
不過據《鋒燦》新聞指出，林飛帆將進入國安會任職，職位將是副秘書長或諮詢委員，而他本人則說「此為總統人事任命權，以新任總統團隊公布為主，我沒什麼其他回應。」
綠委許智傑則大讚，林飛帆從外交、協調、新時代3面向來看相當適合；國安議題需要跨國合作，林飛帆倫敦政經學院畢業，擔任副秘期間國際交流經驗豐富 ；且林飛帆過往是太陽花領袖，擔任副秘書長期間許多部門溝通順暢，是調和鼎鼐的角色。
許智傑說，面對瞬息萬變、資訊快速流通的認知戰，更需要納入新生代，加入不同世代的觀點，同時也能培育國家的人才。
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