國安局長陳明通所指導的學生，例如新竹市前市長林智堅、桃園市長鄭文燦的碩士學位相繼被擊落，而政壇中曾經被陳明通指導的學生不僅2位，還有屏東縣長潘孟安、國發會前主委陳美伶、陸委會副主委邱垂正；還有民進黨立委沈發惠、高嘉瑜、郭國文、邱志偉等。陳明通也因為論文爭議被討論是否續留在國安局。
而民進黨立法院黨團幹事長羅致政昨天也於黨團記者會中，對於陳明通去留問題表示「學術歸學術」，尊重學術單位對抄襲與瑕疵的結論，當事人不論要申訴與否都尊重，而從立法院的角度，希望每個政務官針對自己適任與否做總體的考量，並表示會尊重總統蔡英文的意見。
真理大學人文與資訊學系助理教授陳俐甫分析，陳明通在目前看來是會離開國安局。而陳明通若要跳船離府會有2個時機點，第一個就是等民進黨全盤檢討完後下台。
至於第二個可能的時機點，便是在立法院結束對行政院的預算審議後，內閣宣布改組時順勢離開。因為此時閣揆與部會首長的人事更迭重要性，高於國安局長換人。
陳俐甫舉例，陳明通要是此時呼應外界聲音宣布辭職，可能會成為被放大檢視的對象，因此內閣宣佈改組後，對陳明通要離開國安局也是很好的時機點。
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