鄭文燦表示，在職專班是為了要拓展個人的視野，在2003年進入台大國發所的在職專班，當時基於對中國民主化的議題比較關切，因此選擇了中國基層民主演進的研究主題。惟因當時受限於時空條件，沒有辦法作實證研究，所以採取了文獻分析法，引述了很多的書籍、期刊，或者網路上的文章等等，大概超過100多篇。
而在論文口試的時候，3位口試委員，包括周繼祥所長、陳明通以及林佳龍，3位根據他的問題意識，包括研究的架構、研究的原創發現等等，通過了論文審查。當時的國發所並沒有要求作相似性軟體的比對，沒有這樣的標準，也沒有流行這樣的軟體。經過了10幾年，現在學倫會是根據檢舉，用相似性比對的軟體，找出了一部分沒有引述的論文來源，如果當時有作比對，他當然會把附註跟參考論文都填上去，這是基本的道理。
鄭文燦說，所以他在學倫會的出席聲明也特別針對這一點的寫作瑕疵，並認為瑕疵形成的原因是當時時間較短，或者資料較多，所以有些引述的論文來源沒有作附註，這不是抄襲單一篇論文形成的，也沒有抄襲的意圖，所以他當時就在書面跟口頭都向學倫會致歉。
鄭文燦表示，當然學倫會的審定是可以有不同的處分，包括公開道歉或限期更正，或者其他的撤銷的處分等等。他想不管學倫會作什麼處分，自己大學以及研究所，都是就讀台大。當時報考國發所也是希望能夠進修、提升視野，基於這樣的一個出發點，他對台大還有國發所都是非常感謝的，因此會坦然的面對這個審議結果，也會跟大家再表達歉意。
至於寫作的瑕疵，鄭文燦說，當然未來包括在職專班的碩士論文，將來是不是要建立起同樣的標準，包括論文的相似性比對等等，這個也是有待大學自己來討論檢討。那學倫的審議機制也是一樣，現在是由院長邀集5到7人以不具名方式進行審查，將來針對學倫的分級審議，這個部分也應該是由大學自己來作討論。站在他的立場，他會坦然的去面對學倫會審議的結果。
至於游智彬檢舉時有指控是找人代寫，鄭文燦強調，論文是他自己寫的，這點很清楚。
在這個過程中，包含學倫會找他時，是否有跟陳明通聯繫過？鄭文燦說，有把對學倫會的聲明，傳給了陳明通教授，也有傳給其他兩位口試委員。其實他的口試委員背景有藍有綠，他們也都瞭解，這個論文的寫作主要的主題是，中國在文革之後開始推動基層的改造，包括農村的村自治，以及城市的居民委員會，當時研究的主題是希望從政治學的系統論，來研究到底這樣基層的民主，是提高了政治參與的意識，還是促成了更大的社會控制，有沒有可能從此擴大，成為民主轉型的基礎。基於這樣的旨趣，來作這樣的研究。
他說，因為研究採用的題材跟引用的資料比較多，確實在最後一個階段，他是先寫完草稿，再把每一個引述的論文找出來。有一部分的論文是沒有核對出來的，當時因為沒有作比對軟體，所以事實上在口試的時候，除了格式需要作一些調整以外，並沒有論文來源的比對，10幾年後，用這個新的軟體比對可以找得到，這個當然是他在當時寫作過程的疏失，願意針對這個疏失負起責任，也願意致歉。
由於現在還有中生代接班的問題，有人認為這會影響到整個中生代民進黨之後的布局，鄭文燦認為，學術領域的討論，他願意用學術領域嚴謹的標準來討論，也用這樣心情。畢竟他是從大學到研究所，都是台大的學生，他覺得也是要尊重愛護台大，這部分的心情，我是都不會改變。至於說政治上的事或其他的事情，就回歸其他的標準。
針對許信良指出2024的夢幻名單是「賴鄭配」，鄭文燦表示，現在的首要之務就是要把選後的敗選檢討能夠作得徹底，能夠真切的反應人民的心聲，特別是我們的檢討是多元的、開放的，並沒有上限。從提名、輔選到政策主張，到執政表現，都可以檢討。
鄭文燦指出，有些選民透過選票，表達了他們的訊息。不管是不投票，或者是沒有投給我們，都是有相當的意義的。這樣的意義是希望我們能夠聽到、能夠調整、能夠改變，做為一個政黨，它的生命在於人民的支持，一定要從人民的角度來檢討這次敗選的成因。他覺得這方面的檢討仍然是目前最重要的工作，他也會參與，也會盡量的把各方的意見彙整好，將來才有再出發的契機。
至於檢討中是否包含內閣總辭？鄭文燦認為，內閣是屬於政務的事情，黨務、政務的檢討是包括黨的提名、輔選、政務的執政表現等等。至於說屬於政務部分，當然是府跟院的事情。
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