57歲的孔繁錦曾參加電視益智節目「金頭腦」勇奪總冠軍，被譽為「全台最聰明醫師」，並獲公益團體票選為台灣10大抗憂鬱醫師第1名，女病患因為信任他的專業和名氣，找他求診，沒想到竟在診間被侵犯。
女病患指稱，2021年4月16日她到新北市三重區的孔繁錦診所回診，孔醫師問她最近用藥情況跟心情後，說還要詳談，請護理師帶她到後面診間休息，他要先看別的病患。女病患等著等著就在病床上睡著，聽到鎖門的聲音才醒過來，「孔醫生突然親吻我的額頭，並說很喜歡我、說我很漂亮，我往後面退，他就摸我右邊的腰到小腿之間，我一直跟他說『我不要』、『不可以』，他還是繼續摸」。
接下來的發生事情讓她驚呆，「孔醫生脫掉自己褲子，掀我的裙子，一隻手摸我屁股，並親吻我的屁股，試圖把我翻身，我一直拒絕，他就說『求求妳』、『拜託』、『不然正面也可以』、『不然趴著』，然後一手壓著我的骨盆，另一手從我大腿根部伸進內褲裡，並伸到我的陰道裡面，大約10至15秒，我大力踢腳抗拒，他撞到後面的點滴架才停下，然後穿起褲子並查看點滴架，打開電燈跟門鎖，一開門，聽到聲響的護理師跑來問發生什麼事，他說『沒事』，拍拍我肩膀說『好好休息』，就轉頭跟護理師出去」。
對於性侵指控，孔男在出庭曾說：「首先我不應該追求我的病人，我們先前有相約喝過一杯紅酒，就算追求也不應該發生在我的診所裡面，我非常抱歉，我想她這麼痛苦是因為她覺得我背叛了她的信任還有託付，這件事情對我造成了毀滅性的打擊，媒體撲天蓋地的報導還有網路鄉民的霸凌，我的GOOGLE評分本來幾十則都是全部5星，都是肯定、都是感謝，結果不相干的人來狂刷1星，我的診所業績暴跌。」
孔男還向法官討拍：「我不敢說我是被害人，只是我非常痛苦，我受到很大的懲罰，衛生局、醫師公會、精神科醫學會及倫理委員會都要我寫報告，準備對我進行懲處，我也辭去幾乎所有的社團，也離開慈濟人醫會還有玉里天主堂的劉神父基金會，還有，原本我是所謂的花蓮之光、山東之光、陽明之光、精神科之光，但是一夕之間變成過街老鼠，所有人跟我切割，所以我也變成隱形人，退出所有社交活動，這個事件已經讓我受到非常痛苦的教訓。」
至於自己到底做了什麼事，孔男只承認對女病患性騷擾，有碰觸她腰部、親吻額頭，並在她耳邊說「你好像瘦了。」、「妳真的很美，每次都穿丁字褲嗎？我怎麼現在才發現。」、「是不是喜歡我。」但手指沒有伸進陰道，而他事後向女病患道歉、希望請她吃飯當面賠罪，都是為性騷擾行為道歉，不是為手指伸進陰道道歉，「我想說是不是進展太快，所以才傳訊息說對不起，希望能從頭來過」。
他還辯稱是真心想與女病患交往，所以不可能性侵她，而且丁字褲只有腰部部位驗出他的DNA，女病患陰部沒有驗出，可證他沒有性侵。但法官認為以手指入侵陰道未必會留下傷痕，「沒有射精的手指侵入陰道，更未必會留下男性身體組織」，女病患陰部沒有檢出孔男DNA ，與侵入方式、時間長短，以及採集檢體的時間、方式、部位、多寡有關，而且女病患事後曾向2名閨蜜哭訴，每次開庭也暴哭，諸多事證都指向孔男性侵，審酌他犯後態度很差，一昧抱怨自己被霸凌、診所業績慘跌，歷審都判他4年徒刑。
此外，另名女病患指控孔男在診間以「確認背後痘痘狀況」為由，把額頭貼在她背上說：「那妳有感覺到我喜歡妳嗎？」然後左手摸她腹部，右手從褲頭伸進去，檢方起訴孔男性騷擾後，他在一審期間賠錢達成和解，由於性騷擾是告訴乃論，因此這名女病患撤回告訴後，一審已判決公訴不受理。
孔醫師另涉到一名女病患家中探視，突然擁抱強吻她臉頰與脖子後，丟下6000元鈔票走人，女病患驚呆，事後傳LINE質問，孔男回覆6000元是幫助她度過疫情難關。台北地檢署依性騷擾罪起訴後，由台北地院審理中。孔男先後共被起訴1件性侵、2件性騷擾犯行，被害人都是女病患。
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