此次三讀通過的農業部共設8個三級行政機關、7個三級試驗研究機構，8機關包含農糧署、漁業署、動植物防疫檢疫署、林業及自然保育署、農村發展及水土保持署、農田水利署、農業金融署、農業科技園區管理中心。
7機構為農業試驗所、林業試驗所、水產試驗所、畜產試驗所、獸醫研究所、農業藥物試驗所與生物多樣性研究所；本部設有8司6處，包含綜合規劃司、農民輔導司、畜牧司、農業科技司、國際事務司、資訊司，另新成立資源永續利用司和動物保護司。
農委會主委陳吉仲擔任部長呼聲高，對此，陳吉仲回應，這問題非常難回答，農業部三讀通過不是只有我自己充滿感動，所有農委會同仁、從業人員等長期期待，我們的工作就是回應農漁民訴求，未來農業部長是總統、行政院長職權。
升級農業部後，將致力氣候變遷的農業調適、淨零排放政策、增進農村規畫及發展、糧食安全儲備機制、推動全民食農教育、強化動物福利等、落實寵物管理等，但2大終極目標就是讓農民所得增加、消費者購買到安全農產品。
人事室主任陳慧嬪表示，目前農委會預算員額4770人，行政院目前核給農業部5300人，主要以林務局員1000餘人，升級成林業及自然保育署後會再增加100多人；另外，農村發展及水土保持署、資源永續利用司、動物保護司都會去爭取人力。
會計室主任蘇文樹說明，今年公務預算1506億元，基金預算736億元，加總約2236億元，目前行政院核定2024年「農委會」公務預算比今年增83億元、達1589億元，由於農業部才剛通過，未來還會再爭取，至於2024年的基金預算尚未籌編。
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