食藥署說明，鮮乳殺菌過程必須殺滅病原菌、減少微生物，又不可破壞鮮乳風味與營養價值，目前鮮乳殺菌主要有3種方法，包括低溫長時間殺菌法(LTLT)、高溫短時間殺菌法(HTST)及超高溫殺菌法(HUT)。
而無論是哪種殺菌法，都必須在「7 ˚C以下保存」，因鮮乳雖經殺菌或充填環境良好，初始菌數較少，使得變質、變味所需要時間得以延長，但菌數始終會增加，所以鮮乳一定要妥善冷藏，切勿因沒有變味或變質即飲用。
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