中央政府總預算案剛剛在立法院完成審議，行政院長蘇貞昌在臉書發文表示，敗選當夜，總統以「我已辭黨主席負責，沒有辭總統，你行政院長也不能辭」，二度要我留下。如今總預算案已然通過，此刻，為開創新局，我再向總統請辭行政院長，請總統儘速指派新的閣揆，我將率全體閣員總辭，以利總統佈展新局。
蘇貞昌宣布率內閣總辭後，薛瑞元接受媒體訪問表示，自己也剛剛看到新聞才知道內閣總辭，媒體詢問是否願意留下繼續為國家服務？年後是否還能看到他？薛笑說，「這不是他能夠決定，一切言之過早，我不知道」。
健保部分負擔新制原定前年5月實施，因疫情暫緩，延宕至今仍無確切上路時間，此外，「嚴重特殊傳染性肺炎防治及紓困振興特別條例」將於今年6月30日屆期，為銜接特別條例退場，衛福部研擬《傳染病防治法》分成兩階段修法。
內閣總辭後是否影響部分負擔新制上路和《傳染病防治法》修法？薛瑞元表示，沒有什麼事情是一定某個人才能做。媒體追問有沒有還沒完成的事？薛瑞元笑說，「先不要問我這個東西，這有陷阱」，重申他從未聽說任何包括人選等相關消息，不會去問、也不會去聽。
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