醫療應變組副組長羅一鈞說明，上週共完成123例基因定序，本土47例，境外76例，其中中國佔59例，羅一鈞說，整體來說BA.5仍是主流，而境外移入個案分為中國入境與非中國入境，其中中國BA.5佔68%（40例），BF.7佔32%（19例），其他來源國的變異株種類則較為多元，且境外移入個案中，驗出一例境外移入的菲律賓XBB.1個案，非XBB.1.5新興變異株。
本土定序方面，羅一鈞說，BA.5佔55%，BA.2.75佔28%，較上週19%增加，BF.7佔9%，亦較上週5%增加，上週原預測會增加的BQ.1僅2%，BA.2.75、BF.7增加較為明顯，後續哪一株變異株會成為主流變異株，仍有待觀察，目前看起來還是BA.5穩居第一位。
發言人莊人祥指出，1/7自中國入境來台旅客共1634人，陽性率18.9%，同日通過金馬春節交通專案入境旅客共37位，其中7人採檢陽性，均自金門水頭碼頭入境，陽性率為18.9%。
莊人祥說明，1/7至1/8疫苗接種 60,462 人次，疫苗接種人口涵蓋率第一劑 94%、第二劑 88.9%、基礎加 強劑接種率 0.8%、追加劑接種率 75.9%，第二次追加劑接種率 20.5% (65 歲以上接種率 44.6%)。
金門廈門小三通復航已經來到第3日，不過首日陽性率達18.9%，媒體詢問，是否可能要求旅客在廈門時，要求48小時內PCR陰性證明？指揮官王必勝則回「暫時不會這樣做」，因為回來後就有唾液篩檢，報告出來速度也很快。
王必勝也說，因小三通旅客已會遵從0+7檢疫措施，回到住所也要做快篩，若期間要出門需有2日內快篩陰性結果，有了這些防護，暫時不會要求走小三通要提供48小時內PCR。
過去一周中國入境採檢達19%，媒體詢問，與原先預期是否有落差？將帶來什麼衝擊？王必勝回應「這沒有辦法預測」，由於中國已不做相關統計，無從預測也不會有落差，現只能看實際數字。
王必勝提到，如先前韓國感染陽性率約20%，與中國入境的陽性率有一致性，不過原預估中國感染率較高，這部分則有落差，但中國的疫情從北方到南方，甚至會傳到鄉村，旅客從不同地方陽性率也會不同。
羅一鈞說明，距離春節還有半個月，無法說當時流行的會是哪豬變異株，BA.5應還會是主流、不會這麼快退散，其他還有待觀察，目前看起來BA.2.75有持續增加的趨勢，且BA.2.75與BF.7等相較其他新興變異株，免疫逃脫優勢弱一點點，若是此兩個變成主流，傳播力不會像XBB、BQ.1影響這麼大，而新的變異株在重症風險等方面沒有太大差異。
王必勝則補充說，現在的變異株均屬Omicron家族，重症、致死率沒有太大差別。
中央流行疫情指揮中心今(9)日公布國內新增134例Omicron亞型變異株確定病例，分別為47例本土個案( 26例BA.5、13例BA.2.75、4例BF.7、3例BA.2及1例BQ.1)及87例境外移入( 51例BA.5、10例BA.2.75、21例BF.7、4例BQ.1及1例XBB)。截至目前國內累計檢出之Omicron亞型變異株境外移入確定病例：XBB為28例、BF.7為43例、BQ.1為35例、BA.5為1,376例、BA.4為104例、BA.2.75為135例、BA.2為1,030例；另累計本土確定病例XBB為3例、BF.7為9例、BQ.1為15例、BA.5為1,553例、BA.4為5例、BA.2.75為36例、BA.2為2,537例。
指揮中心指出，新增26例BA.5本土個案，占上週所有已定序之47例約55%，為13名男性、13名女性，年齡介於未滿5歲至90多歲以上，分布為北部15例、中部5例、南部4例、東部2例，確診日介於去(2022)年12月8日至12月29日。
指揮中心表示，針對國內境外移入之87例BA.5、BA.2.75、BQ.1、XBB及BF.7個案，為54例男性、33例女性，年齡介於未滿5歲至70多歲，入境日介於去年12月14日至今(2023)年1月3日。其中檢出51例BA.5個案分別自中國(40例)，日本(4例)，香港及韓國(各3例)移入，另1例感染國家調查中；10例BA2.75個案分別自日本(4例)，泰國(3例)，英國(2例)，韓國(1例)移入；21例BF.7個案分別自中國(19例)，日本(2例)移入；4例BQ.1個案分別自美國、泰國、荷蘭及德國(各1例)移入；1例XBB個案自菲律賓移入。
指揮中心說明，世界衛生組織（WHO）於今年1月4日資料指出，全球已發現超過540種Omicron次分支變異株及60種重組變異株；目前BA.5變異株佔比約為63.7%，仍為全球主流株惟佔比略降；BQ.1、BA.2.75及XBB及其子代變異株佔比持續增加，已於至少70-90個國家檢出，佔比分別約44.9%、11.8%及6.8%(含XBB.1.5)；其中近期XBB.1.5變異株已至少於29國檢出，於美國及歐洲佔比上升。
BQ.1、BA.2.75及XBB等變異株多已發展出免疫逃脫特性，具較佳增長優勢，惟是否引發新一波疫情仍取決於該地區人群免疫力、既往Omicron疫情發生時間與規模及疫苗涵蓋率等要素，現有證據顯示疾病嚴重度影響未明顯增加；另WHO專家表示XBB.1.5變異株傳播能力顯著增加，刻正密切評估其風險程度，將持續密切監測國際間之病毒株演變與流行。
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