2018年卡管案鬧得沸沸揚揚，讓台大長達百日群龍無首，最終教育部宣布「勉予同意」管中閔出任台大校長，也才終結台大無校長局面。
由於管中閔即將卸任，在最後一次的校務會議中，他也坦言即將卸任的心情是如釋重負，隨後便談到了當年教育部的勉予同意，管中閔說，4年走來與學校共同發展，所有的成功都應該歸功於行政團隊，他們也是4年來台大的支柱，對於這些成果，希望師生們不是「勉予接受」而是樂於肯定。
話鋒一轉，管中閔指出，這4年的校務經驗，讓他知道「離真正的大學自治尚遠」，沒有真正的大學自治，台大和其他大學就難以脫胎換骨、充分發展。接下來卸任後，也會持續關注這項議題，同時回到財金系後會持續教學研究工作。
另管中閔接受聯訪時被問及4年任期中，將台大的收支餘絀由負數轉為正數，對於如何做到，他指出，第一個經費使用方式，再來是財務投資，以及校友的捐款，這也可以減輕負擔。
出身管理學院財金系的管中閔也幽默表示，「我這個系還是有用的」，台大收支能由負轉正，而且是從負6、7億到轉正，這不是只把經費東發西發，而是做很小心的規劃，但這些東西前幾年沒有特別講，因為財務東西不是只看一年，都是一段時間的，他等了4年才能講，「苦啊！校長苦不能說」。
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