因應特別條例屆效，為延續新冠肺炎相關疫情因應措施，疾管署擬分兩階段修正《傳染病防治法》，第一階段針對未來緊急採購疫苗、快篩等防疫物資的法源依據；第二階段針對隔離檢疫相關措施，衛福部長薛瑞元日前表示，修法相關具急迫性問題，上週已經整理好，莊人祥今進一步表示，目前還需要安排時間向薛報告相關內容，因此尚無法對外說明。
針對第一階段修法內容，各界擔憂本次疫情期間只靠政府採購疫苗、民間藥廠無法投入採購的情況重演，前疾管局副局長施文儀建議，本次修法修法應規定疫苗可比照藥物、開放各代理商去採購，進口後依照政府流程檢查就好，不限於指揮中心或疾管署才能買，若沒有廠商想引進，政府也保有採購能力，這樣人民權益也不會受損。
但莊人祥無奈表示，透過修法並不能解決此項問題，因為疫情期間、廠商在只有緊急授權的情況下，通常都只會與政府交易，所以即便立法，也不一定能讓民間在疫情大流行期間買到疫苗或藥物，除非疫情像流感等其他疾病常態化，或是成為自費藥物，才有機會進行購買，最大癥結點就在於「外國藥商也只會賣給政府」。
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