今年10月，海生館公告標售巴布亞企鵝24隻、頰帶企鵝6隻、阿德利企鵝6隻，共36隻，引來網友喊揪團團購！館方隨即解釋，欲競標者須具野生動物飼養業、批發業資格外，還會了解收養環境、飼養人員是否專業等軟、硬體養育條件，若不符條件，「就是出再高的錢也不賣！」招標作業為此暫喊停，競標條件還在重新研議中。
這次標售是館方開館以來的第3次賣企鵝，館方就企鵝種類、年齡、避免近親繁殖考量，挑選最適合的數量、物種標售。館方表示，企鵝復育有成，數量越來越多，但海生館照養環境，總量適宜110隻，為不致窘迫，辦理企鵝標售。
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海生館委外營運的海景公司生物部經理李晨寧表示，企鵝館內的溫度必須監控，以攝氏0度最適合，控制在正負2度之間，水溫則為攝氏5度，控制在正負2度內，這樣的溫度企鵝最喜歡。
不僅如此，飼育員在企鵝行走動線上鋪出厚厚的小碎冰，讓牠們踩踏時感到舒適，這些小碎冰，隔天會沖洗掉，再鋪上新的碎冰，這是館方營造企鵝生存環境的日常。
「每年為企鵝安排一次健康檢查，身高、體重，還要抽血檢驗」，李晨寧細數照顧企鵝就像養小孩一樣費心，若發現健康異常，獸醫立刻介入治療，例如尿酸過高，就依症狀投藥或調整飲食。
照顧剛孵化後的雛企鵝步驟更是繁瑣，李晨寧說，親鳥吐出反芻物餵鶵企鵝，鶵企鵝在父母的肚子下保護進食，待40到50天後，鶵企鵝轉成亞成羽後，即會離巢，館方這時介入，讓牠習慣人工餵食。
人工餵食一天餵2次，多投食沙丁魚，食量約是企鵝體重的1成；館方也怕有些企鵝沒吃飽，適時擺放魚食，如同讓牠們想吃時就開動Buffet。
模樣可愛的企鵝還喜歡吃柳葉魚、秋刀魚、南極磷蝦等。至於每隻企鵝的每月飼養成本，館方只透露，不便透露具體數字，但每月有上萬元。
館方表示，依據國際間的動物園與水族館動物福利「黃金標準」（AZA animal welfare），企鵝飼育時若達6隻，每隻企鵝所需的陸域面積為0.74 平方公尺，第7隻起每增加1隻，所需的空間為0.37平方公尺。屏東海生館館內企鵝展示區陸域空間有126平方公尺，目前是符合標準的。
館內目前有巴布亞、頰帶、阿德利及馬可羅尼等4種企鵝共百餘隻，這些企鵝都約於每年7至8月間進入繁殖季，正常狀況下，一對企鵝一次可產下2顆蛋，但產下的蛋，不是每顆蛋都會孵化，若有孵化，從雛企鵝到長大過程，也會發生夭折等現象。
館方目前每年約有交配孵化50顆蛋，但後續孵化等，又因先天或後天條件等因素，及孵化後照養鶵企鵝情形，每年復育成果都略有變化。
阿德利企鵝
學名：Pygoscelis adeliae
特徵：體長30至50公分，重4至5公斤；頭部藍綠、嘴黑、眼圈白色、嘴角有細長白羽圍繞，尾部較其他企鵝尾部稍長。
習性：群體覓食、築巢、社交，以南極磷蝦、側紋南極魚等小型魚類為主食。
分布：南極羅斯海區域，南極幅合帶以南海域。
頰帶企鵝
學名：Pygoscelis antarcticus
特徵：頭部帽冠如綁條頰帶，對入侵者易凶巴巴，有企鵝界的戴帽警察之稱。體長約70公分，重約3至5公斤。
習性：以磷蝦、小魚為主食。
分布：南極幅合帶北部區域，是南極旅遊行程易看到企鵝種類之一。
巴布亞企鵝
學名：Pygoscelis papua
特徵：因頭部有白色帶狀似頭巾花紋，被戲稱是企鵝界「異教徒」。細長嘴角呈橙紅色、眼角處有一橙紅色三角形。體長75至90公分間，重約8公斤，為第三大型企鵝（前二名是皇帝、國王企鵝）。
習性：企鵝家族中游泳最快，時速可達36公里；以磷蝦、較小型甲殼類動物、小型魚為主食。
分布：很多南極地區島嶼都有分布。
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