16:00關水門遲至16:25才公告
台北市政府水利處16日上午7時30分透過媒體發布，8時只出不進，並開放紅黃線停車；10時18分則宣布11時關閉淡水河延線疏散門；北市府則於下午2時37分提醒，基隆河、新店溪水位高漲，恐緊急關閉疏散門，堤外車輛應盡速移出；北市府並於下午3時37分宣布關閉基隆河沿線疏散門；水利處則於下午4時25分才告知媒體，4時起關閉基隆、新店溪、景美溪沿線疏散門。
百齡橋下停車場16日晚間淹水，造成逾50輛車未移走慘遭泡水。附近的通河街325巷(三腳渡碼頭)則有3人受困停車場，包含男性困在籃球場，緊抓籃球架等待救援，還有女性受困於泡水的車內。因此就有民眾質疑，水利處通知時間都少於30分鐘，多數都趕不及開走，讓人無法應變，且未直接拖吊車輛，無法守護民眾財產安全。
暴雨依SOP關水門時已來不及拖吊
台北市長柯文哲喊的「關水門SOP」到底是甚麼流程?水利處河工科長范振峰說明，分颱風和暴雨兩種，由於颱風路徑可預測，作業時間充裕，SOP是關水門前6小時公告，3小時前開始關，2小時前開始拖吊；暴雨SOP則是觀察河川水位達三級警戒就須關水門，中央定義是河水兩小時內會漫淹到河濱公園或市區即達三級警戒，尼莎颱風造成的豪雨來的快又急，當河川水位達三級警戒關水門時，根本來不及拖吊車子。
范振峰指出，16日暴雨狂下，不像颱風可預判路徑且準備時間足夠，約颱風半徑觸碰到台灣東北角就要關門，豪雨只能觀測水位，雖預估可能上升，但不確定是否需要關門，因此持續觀察水情。
范振峰表示，於16日早上7時許發布，8時開始只出不進的訊息，附帶市區紅黃線可停車，宣導民眾移車至市區。而只出不進的消息發布後，民眾就要預警可能關門。
范振峰進一步說道，16日下午北市開始有長延時強降雨，河水急速上升，觀測到水位就要到達三級緊戒並關門，因此下午3時許通知立即關閉疏散門，從決定關水門到滿出來可能1、2小時而已，門沒關河水可能就會灌進市區，因此沒有時間拖吊。
議員批:卸責脫罪說法
秦慧珠批評，「水利處這種說法我是沒有辦法接受的」，16日早上開始像「潑水」的下雨且不間斷，外面跑行程都可以以常識判斷，一定會有災情發生，水利處當天早上雖宣布8時起只出不進，「不負責任的說法，因為你說只出不進，但沒有說要關閉。」應至少提前2小時公布關閉時間，讓民眾有緩衝期可移車，過去SOP也都是這樣。
秦慧珠痛批，「所有SOP都是大人不在家，大家參考範例，所以我覺得真的非常糟糕，這次的事情從上到下都要檢討，然後水利處也是脫罪。」「你沒有明確的規定，沒有按照SOP，沒有很精準的發布訊息，就是不對。」
秦慧珠也砲轟，台北市長柯文哲16日至南投、台中進行輔選行程，傍晚才取消行程北返，還稱北市府有SOP，由副市長彭振聲坐鎮。但SOP顯然只是空話，柯文哲沒有回來指揮也沒有SOP，下面的人又搞不清楚狀況，導致許多市民受害。而柯將責任推給彭，如僅只剩彭1位副市長卻業務加重，柯文哲又去處理競選行程，彭也很可憐。
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