氣象局表示，周一、周二(9/12、9/13)梅花颱風更接近台灣，北部及東北部地區、中部山雨勢會更明顯。
航港局表示，今日僅有布袋/高雄-馬公、將軍-東吉、東港/鹽埔/大鵬灣-小琉球正常開航，臺東綠島航線因今日已受梅花颱風外圍環流影響，已協調業者調整航班於上午加強疏運，後續視海象及疏運情形適時開航。
另因小琉球航線12日僅琉興輪上午7時一航次自小琉球返回東港，因此航港局提醒民眾儘量利用今日航班返臺，而航運業者也將在今日適時增開船班疏運。
此外，臺南將軍-東吉航線12日亦受影響全部停航，今日有4航次往返，呼籲民眾提早因應。相關資訊航港局除已事先連繫臺東、屏東及臺南縣政府協助宣導當地旅遊旅客知悉外，並同時督促業者儘速通知受停航航班影響之訂位旅客因應。
至於馬祖及蘭嶼部分因今（11）日全部停航，航港局昨日即已啟動疏運，馬祖往基隆加開1航次、蘭嶼加開10航次，無未能搭上船班之旅客，登船狀況良好。
★明日(9/12)海運本島與離島間11條航線，開/停航情形如下：
（一）臺馬航線：全數停航/3航次(基隆馬祖2航次、臺北馬祖1航次)
（二）臺澎航線： 1.高雄馬公線：正常開航/ 1航次 2.布袋馬公線：全數停航/ 5航次 3.將軍東吉線：全數停航/ 2航次
（三）東琉航線 1.東琉線：開航/ 1航次(公船琉興輪7時/1航次)；停航/49航次 2.鹽琉線：全數停航/ 12航次 3.鵬琉線：無航班
（四）東部航線 1.富岡綠島線：全數停航/14航次 2.富岡蘭嶼線：全數停航/ 4航次 3.後壁湖蘭嶼線：全數停航/ 4航次
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