海軍司令部參謀長邱俊榮中當時將指出,針對小型目標,海上的所有事務都是由海巡與海軍共同聯繫應處,對於海上目標的掌握有其困難度,包括目標大小、天候氣象等,像小型快艇,確實掌握有限,未來會與海巡共同強化合作。
根據中時報導,國防部原先規劃陸軍海龍蛙兵進駐淡水河防務,但恐受外島加給遭到取消,影響官兵留營,因此改由陸戰兩機偵搜大隊派遣蛙人進駐,位在龜山的陸戰66旅也將支援突擊小組,除了使用M109突擊艇外,也有機動性高的CRRC突擊舟駐守,對敵進行反突擊任務。除海軍增派任務兵力外,海巡也已加派多功能巡緝艇進駐河口,同時新增河面巡邏、機動目視辨識目標勤務,在陸戰隊偵搜大隊加入防務後,將更強化淡水河反斬首任務。