不過，行政院同時函告「台中市食品安全衛生管理自治條例」有關瘦肉精零檢出的規定無效，市府同樣提起行政訴訟，一審被駁回後上訴，最高行政法院認為牴觸食安法，判決駁回定讞。對此，中市府深感遺憾，表示未來將持續肉品源頭與市售端的稽查與抽驗，同時主動揭露檢驗結果，提供市民消費參考。
台中市教育局表示，市長盧秀燕重視學生健康，因中央宣布2021年起開放美國萊豬進口國內，台中率全國之先，於2020年底即要求全市學校修改午餐契約，明定學童的營養午餐只能使用國產在地生鮮肉品及其相關產製品，不得使用進口肉品，同時只要查出使用，一次記罰20點並立即終止契約、公布業者名單，為全國最嚴格的學校午餐契約罰則。
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2021年為加強對於食安的要求，市府同步修正台中市學校午餐自治條例，禁止萊豬進校園，但該項規定於2022年6月9日遭行政院函告無效，市府為捍衛全市學生校園「食」的健康，提起訴願被駁回後改提行政訴訟狀告行政院，訴請撤銷原訴願決定及原處分。
台北高等行政院法院認為「台中市學校午餐自治條例」係由立法機關市議會通過，而中市府為自治團體的行政機關，非立法機關，並未因為該自治條例規定被行政院函告無效而受有直接侵害，因此，中市府對原處分提起行政訴訟「不適格」，予以駁回。
中市府今天表示，經提起上訴，最高行政法院今天（30日）判決中市府勝訴確定。至於勝訴理由，市府並未說明，有待判決書進一步公布。
教育局強調，未來教育局將持續落實學校午餐肉品查驗及三級訪廠工作，絕不讓含有瘦肉精之肉品進入校園。
法制局表示，臺中市學校午餐自治條例第4條第1項第2款規定，學校提供午餐，「不得使用肉品原料來源非國產之各式肉類加工品」，雖經行政院函告部分無效，但經最高行政法院判決撤銷該函告無效的處分，確認了市府在學生午餐食材選擇方面具有地方自治權責，感謝法院的判決。
法制局表示，守護學童健康的健康一直是市府的施政目標，讓孩童吃到安心又健康的食物是唯一宗旨，市府將在收到判決後，進一步研擬及確認台中市學生午餐的政策規劃及法令制定。
法制局也說，此案對於未來禁絕萊豬進入學校具有指標性的意義；另外，對於賦與市府未來執行稽查措施的法令依據亦具有重要價值，市府會基於地方自治的職能，持續維護市民的食安權益。
對此，食安處也說，為維護市民權益及食品安全，市府持續查驗市售肉品，113年共查驗13,948件、動員8,002人次，其中31件牛肉檢出微量萊劑，符合中央規定。所有查驗結果皆公布在「臺中市重大食安議題專區/萊劑肉品專區」，民眾可隨時上網瞭解，市府亦將持續查驗為民眾把關。
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