李孟諺今被爆出曾與一名女子婚外情10年，最終在李升任部長後，被始亂終棄；稍早李孟諺聲明，針對其個人過去行為造成太太與家人的莫大困擾，以及導致社會大眾觀感不佳，他由衷表達最深歉意，並向總統賴清德、行政院長卓榮泰請辭。
行政院對此表示，卓榮泰感謝李孟諺自擔任公職以來戮力從公，不僅過往在任職行政院秘書長期間協助政府推動多項重大國家建設、推行眾多福利措施，擔任交通部長期間除致力改善道路交通安全外，亦接續處理0403花蓮震災後鐵公路及觀光產業重建事宜，並妥善因應凱米颱風風災道路交通災損復建事宜，公務表現優異且殊值肯定。不過為尊重李孟諺個人意願，並肯定其勇於面對之態度，行政院長卓榮泰准予辭職。
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