賴瑞隆指出，旗津每逢6至8月大潮期間，因地勢低窪常有海水倒灌發生，加上颱風侵襲，有強降雨致災之虞。去年邀集中央地方政府單位協調，請高雄市政府水利局提出旗津治水改善計畫，並成功爭取中央1億元經費，盤點旗津因海水倒灌或低漥處易淹水地區，包含廟前路、大關路30巷、發祥街、上竹巷、慶富造船廠旁、南汕巷、聯興造船廠、中洲漁港、旗津天聖宮前等共計11處進行改善工程，將採排水路出海口設置閘門、搭配抽水機及堤岸加高因應。
高雄市政府水利局表示，第一期工程，改善範圍包含旗津廟前路和大觀路30巷、發祥街與中洲三路、上竹里慶富造船廠側等，中央已核定總經費5700萬元，已於7月開工、預計8月底完成閘門，12月完工。第二期工程，包含上竹漁港、南汕巷、上竹巷聯興造船廠前、中洲漁港等地，總經費4500萬元，會勘取得土地使用後提報經濟部水利署、內政部國土署爭取經費，預計年底前完成發包，明年6月前完工。
高雄市政府海洋局表示，旗后漁港碼頭使用至今已有30餘年，港區基本設施與環境老舊不堪。去年已啟動第一期旗后漁港老舊碼頭整建工程，改善南碼頭155.2公尺。第二期工程將改善西碼頭、北碼頭、東碼頭及改善老舊碼頭淹水問題，預計採用板樁式碼頭斷面(海上施工)進行碼頭整建工程，總經費1.3億元。此外上竹漁港南碼頭使用超過40年，設備環境亟需改善，市府規劃改善南碼頭65公尺及周邊港區設施，總經費4448萬元。海洋局將爭取農業部漁業署預算補助，以改善旗津區漁港區域大潮易淹水情形。
賴瑞隆強調，旗津區因水路複雜、且土地權管橫跨中央地方各機關，增加治水工程困難度。請經濟部水利署、內政部國土署、農業部漁業署和高雄市政府密切合作，高雄市政府盡速提報計畫至中央後，將全力爭取治水工程經費到位，並持續針對其他易淹水區域進行盤點、改善，以徹底解決旗津長年淹水問題。
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