中國海警局指稱，「該漁船（大進滿88號）違反伏季休漁規定，在底拖網禁漁區線內違規拖網作業，且使用的網具遠小於國家規定的最小網目尺寸，破壞了海洋漁業資源和生態環境。」
後續台灣海巡艇試圖將漁民帶回，遭到中國海警船攔阻，讓兩岸緊張情勢升高。
對此柯文哲表示，中國方面應釐清真相並公開說明，盡速釋放人船，不要造成後續負面影響。同時他也認為，兩岸應該要啟動正式溝通管道，避免一再發生事件，使彼此的敵意有增無減。
柯文哲也呼籲中國要好好思考，從共機、共艦不斷擾台、國台辦發布懲戒清單，兩岸之間惡意螺旋升高，如今又強勢帶走台灣漁民，如果中國主張是合理執法，也應該清楚說明台灣漁船違規事實，不要讓政治力影響兩岸漁業常態，放任兩岸之間對立情緒滋長。
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