外交部對於應曉薇指控外交部對於此案「我行我素、不對外說明、連對外新聞稿都沒有」，對此表達抗議並嚴正說明，此案已進入司法偵查階段，外交部持續在不影響案件偵查及不違反偵查不公開的原則下，本於毋枉毋縱的立場，全力協助配合司法機關的偵辦工作，不應被惡意扭曲及抹黑。
外交部並對於應曉薇質疑「本案4月18日已向檢調提告偵查真相，但外交部得悉後，仍於4月20日左右派政風調查團赴聖保羅進行行政調查」，外交部對於應曉薇意圖影射外交部擾亂檢調過程的說法，不能接受。
外交部指出，當初為釐清事情原委，外交部政風處組成專案調查小組前往巴西聖保羅實地調查，調查期間與台北地檢署承辦檢察官都有保持密切聯繫，承辦檢察官也知悉外交部前往進行相關行政調查事宜，外交部行政調查結果也在今年5月24日提供承辦檢察官。外交部在此案的行政調查作為，絕無違反政風機構執行行政調查作業要點第17點規定。
外交部重申對前駐巴西聖保羅辦事處組長王之化逝世的哀悼與不捨，同時籲請外界理性尊重司法檢調的相關偵辦作業與程序。
全案源於今年3月10日，王之化在聖保羅16樓住處墜樓身亡，遺孀俞惠敏向媒體投書，她寫給外交部長吳釗燮的公開信，質疑丈夫死因不單純，疑似是不願核銷一筆近40萬美金（台幣約1220萬餘元）官邸修繕費，被馮光中狹怨報復，馮還聯合陳姓秘書，意圖設計栽贓丈夫貪污公款。
4月6日俞惠敏帶著王之化遺體返國，並舉辦告別式，事後她在應曉薇等人陪同下舉行記者會，會中她難過表示，丈夫遭惡意污衊，原本懷著滿腔熱血到異鄉，如今成為一具冰冷屍體，丈夫為證明自己清白，不惜粉身碎骨，以死明志，她為了捍衛丈夫清白，不怕遍體麟傷，希望各界替她討回公道，她並公布丈夫生前的錄下的一段錄音，他在錄音中強調「我沒有拿公家一毛錢」。
應曉薇後來又公布2月間馮光中與在地廠商對話的2段錄音檔，質疑馮光中涉嫌貪污、圖利特定廠商，內容是馮利用在當地用工程標案，向廠商索要洗衣機等家電，還明確指出要求廠商能核銷洗衣機、洗碗機等相關費用，才把工程包給廠商等語。應曉薇認為，錄音檔中馮講的一些字眼已涉及圖利、貪污罪。
家屬事後也對馮光中提出告訴，檢察官23日約談馮光中到案說明，複訊後諭令10萬交保。
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