林佳龍2018年11月尋求連任台中市長,結果以21萬之差輸給國民黨盧秀燕;次年1月接受行政院長蘇貞昌邀請,出任交通部長,任內林佳龍曾召集北北基三市首長共商軌道路網整合,也提出高鐵延伸至宜蘭、屏東的規劃。
然2021年4月2日408次太魯閣號在花蓮清水隧道前出軌,釀下台鐵史上最慘事故,49人死亡、300餘人受傷,林佳龍因太魯閣號事故,擔起政治責任、辭職;2022年1月5日,林佳龍受蔡英文特聘為無任所大使,當時國民黨痛批是政治酬庸,實際上無任所大使為榮譽職並無給職。
2022年4月林佳龍表態參選台北市長,其後率先提出台北首都圈的12門願景,展現選的堅定意志,面對蔡英文多次徵詢參選新北市長,林佳龍都拒絕。選前4個月(7月),林佳龍被說服改戰新北市,媒體並引述正國會人士說法報導,蔡英文答應若林選的不錯,有機會選後擔任行政院長,當時總統府及林佳龍競選辦公室都出聲明駁斥。
林佳龍的戰場急轉彎,惹來國民黨砲轟質疑林無心選新北市長,改戰旨在拚選後入閣,並檢視他過去承諾,包括2018年曾說選後絕對不會離開台中市,結果去接交通部長;九合一選舉講了24次不選新北市長,最後還是接受民進黨徵召,國民黨批評林誠信有問題。
新北市長選舉結果,林佳龍慘輸國民黨侯友宜45.8萬票,且票數在新北市29行政區通通落後,相較2018年蘇貞昌參選新北市長,落後29萬票,林佳龍這次戰績更為慘烈,拉大新北的藍綠差距。
林佳龍2次參選落敗後,都曾表達要沉潛、調整步伐,不過沉潛1、2個月,即又步步高升,蔡英文日前二度徵詢林佳龍接任總統府祕書長的意願,林佳龍昨天點頭答應接下,並將於下周正式接棒李大維。
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