李雅慧、黃雍琇表示，根據公視新聞網臉書2015年11月22日引述淡大同學說法，稱柯志恩「在其學務長任內已有諸多爭議，包含表決反漲學費時將反對學生代表趕出開會現場等」，所以對其出任國民黨不分區立委名單「學生們都在看柯將有何作為」。
2016年進入國會後，「柯立委」不只主張要讓私校「學費自主」，還稱「當繳學費等於進入好企業時，怨氣不會這麼大」，實際上高學費的國家，青年失業率卻高漲的案例比比皆是，柯志恩卻利用家長望子成龍的心情錯誤類比，而當教育部將包含淡大在內學校漲學費的申請駁回時，「柯立委」又酸「每次傳出學費調漲，民間就強烈反彈，政府為了選舉也不敢調」，完全不知民間疾苦。
李雅慧說，柯志恩或許在課堂上是位專業、風趣、受人尊敬的老師，但不論是在校擔任行政職，或是出任不分區立委「都走鐘」，至少在學費議題完全不顧學生與家長感受；黃雍琇更質疑，當年會把學生趕出去的學務長，「未來當市長會不會否也把不同意見的市民趕出去？當年主張漲學費的立委，未來當市長會不會也常拿小老百姓荷包開刀？」都值得市民深思。
柯說，私校調漲學費那個時候是在討論階段，很多私校校長希望能夠透過調漲學費，來發展私校特色，不過前提是可能沒有教育部的補助，那在沒有教育部補助的情況之下私校如果能發展特色，然後讓學費自主。
柯志恩回應，議員可能搞不清楚學貸跟調漲學費是完全兩碼事情。所謂的學貸是針對清寒家庭，年收入在114萬以下，「希望能夠延長償還的期限，請問這何錯之有？」
民進黨議員沒有辦法搞清楚學貸跟學費之間的差別，柯志恩說，她覺得非常的遺憾，這個部分請對方先釐清吧！她強調，幫清寒學生來爭取三年之內免利息何錯之有？調漲學費主責權在教育部，學校可以提出需求，但最後都會教育部給否決。這是兩碼不同的概念，請議員把這兩個概念跟條文看清楚搞清楚再來問柯志恩吧。
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