台南市民政局經調查確認，武玄壇是未立案的宗教場所，該地址為營業中登記立案工廠，且內部有機具設備，建築物增建部分屬違建，將請區公所予以查報，而現場有法事收費價目表，後續也會移請稅務單位查處是否有逃漏稅。
武玄壇日前公布神明合婚消息，指出武玄壇關聖帝君要和北汕尾鹿耳門天后宮媽祖合婚，還將媽祖冠夫姓稱呼為「天上關聖母」，引發外界不滿，對此，天后宮發聲明稱事情不知情，擅自「合婚會香」，侵害廟方聲譽，揚言提告，而武玄壇也不甘示弱強調，對於惡意謾罵者，將蒐證提告。
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