丁昱仁解釋，一般刑事告訴會先向地檢署提告，經檢察官起訴後，才由法院審理，一般而言很少直接向法院提起自訴，因為提起自訴時，需要自己擔任公訴檢察官的角色，蒐集並提供證據交由法官判斷，而林智堅的碩士論文已被台大認定抄襲余正煌，也因此余正煌應是認為證據十分充足、明確，不需要再經由檢方蒐集調查，才直接提起自訴。
不過李茂增認為，余正煌提自訴，應是對檢察體系的不信任，畢竟偵查不公開，余正煌應是想透過提自訴讓全案公開，讓大家去旁聽，李茂增也認為，余正煌這麼做是正確的選擇。
林智堅先前宣布參選桃園市長後，爆出論文門事件，雖他矢口否認抄襲，但台大今年8月公布調查認定，林智堅論文的摘要第一、第三、第四章及結論都有大幅度抄襲，甚至連英文錯字都一模一樣，不符合學術倫理要求。
且台大在審定過程3度邀請林智堅和指導教授陳明通出席，另邀請余正煌出席2次，林智堅和陳明通卻都沒現身，只有余正煌出席1次說明，審定委員會最終認定林智堅論文大量抄襲，不符基本學術倫理要求，建議撤銷林智堅的學位。
★快點加入《壹蘋》Line，和我們做好友！★
FB按讚追蹤《壹蘋新聞網》各大臉書粉絲團，即時新聞到你手，不漏任何重要新聞！
