根據疾管署長莊人祥的推估，從5月底到8月初，全台可能將有高達170萬人次因新冠就醫，高峰期可能落在6月底到7月初，單週就醫人數甚至超過20萬人。醫界擔心補助減少會影響基層打疫苗的積極度，進而加劇疫情擴散，呼籲政府儘快改善補助制度，否則難以鼓勵第一線人員投入防疫工作。
不只疫苗補助減少，基層醫師也指出，快篩補助從300元砍到150元，加上還得面對被感染的風險，讓醫護人員叫苦連天。羅一鈞說，目前每種公費疫苗的施打處置費統一是100元，之前新冠疫苗補助200元，是因為有臨時加碼，指揮中心解編後已恢復常態。衛福部也正研議提升整體補助標準，讓醫護能有更多誘因投入防疫。
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為了解決基層困境，衛福部在5月6日立法院公聽會後，邀請醫師公會、診所協會、感染症與急診學會等團體召開研商會議，由邱泰源部長親自主持。會中針對疫苗與藥物配置、快篩供應、分流就醫等議題討論，並下令全力協助基層防疫。食藥署表示目前快篩供貨穩定，每週可出貨4.5萬劑，健保署也開放各界提案，檢討快篩補助點值。
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