此項爭議源於醫師公會日前提出「同工不同酬」的改革建議，希望將診所藥品調劑費提高與藥局調劑費一致。先前醫師公會認為，藥師包藥有其專業，但是診所藥師的藥事服務費只有39點，患者拿處方箋到西藥房領藥卻是給付54點，同工不同酬並不公平，希望可以針對診所藥局每日前30位病人給付提升至與藥局一致。
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健保署副署長龐一鳴表示，今日會議確實討論並初步結論將把診所藥事調劑費提高到54點與藥局一致。他承認會中有部分團體表達不滿，並表示尊重藥師公會表達意見的權利。
對此，藥師公會全聯會理事長黃金舜表示，「藥師公會全面反對」此決定。他指出，診所與社區藥局在設備和服務項目上存在顯著差異，不應簡單地將兩者的藥事服務費統一。黃金舜還批評，醫界似乎通過立委和健保署施壓，強行在今天的會議中做出決議，這種做法令人無法接受。
黃金舜進一步指出，當初制定醫院、社區藥局和診所的藥事服務費分別為61點、54點和39點，是為了逐步實現醫藥分業的目標。他認為健保署此次的決定等同於將醫藥分業的精神完全摒棄。為表達強烈不滿，藥師公會代表在會議中全數退席以示反對，並計劃實際走上街頭的陳抗行動。
黃金舜表示，醫界已經獲得健保點值保障（一點0.95元），現在還要進一步侵占其他資源。他認為這種做法不僅踐踏了所有醫療人員的權益，也凸顯了主管單位的無能和缺乏擔當，直言，「我們不能容忍主管單位如此無能」。
根據中華民國藥師公會全國聯合會發布聲明指出，8月7日，藥師公會收到立法委員賴惠員辦公室的會議通知，計劃討論相關議題。然而，8月13日，會議突然被通知取消。但在8月22日的健保署會議上，藥師公會代表發現該協調會實際上並未取消，只是片面通知藥界取消參與，這種做法被視為欺瞞手段，意圖排除藥界聲音。
為了表達強烈反對立場，藥師公會全聯會計劃於8月23日召開「常務暨縣市公會理事長聯席會議」，並計劃前往健保署進行陳情抗議。
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