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疾管署統計自2023年9月26日年XBB疫苗開打以來，本土通報確診併發症及新冠死亡病例中未曾接種XBB疫苗者占99%。莫德納XBB疫苗自2023年9月開打，Novavax XBB疫苗則是2024年1月9日開打，截至1月11日，兩種廠牌新冠XBB疫苗合計接種102.7萬人次。
「台灣XBB疫苗接種率實在不好」，林口長庚副院長邱政洵表示，從新冠死亡病例9成是老人且沒打XBB疫苗，這告訴我們疫苗的公共衛生意義，但現在民眾對疫苗疲乏，忽略疫苗重要性。
台大兒童醫院小兒科主治醫師黃立民說，只要感染就有風險，年紀大抵抗力差、共病多、若又沒接種新冠疫苗，感染容易併發重症，死亡率高。目前新冠疫苗接種兩大基本原則，一、至少每年打一劑新冠疫苗，二、新冠病毒平均6個月出現一個新變異株，當出現新變異株，長者需要和高危險族群要維持免疫力，可以考慮再補一劑，6個月之內有打過疫苗比較安全。
邱政洵表示，疫苗中和抗體平均三到六個月就會下降，目前整體趨勢建議一年至少打一劑新冠疫苗，但他認為不需要重複接種XBB疫苗，T細胞免疫會持續比較久，即使感染也比較不會重症。
疾管署近四週變異株監測總計，本土檢出病毒株以EG.5 (63%)為多，其次為JN.1 (24%)；境外檢出病毒株以JN.1 (63%)為多，其次為EG.5 (26%)。疾管署副署長羅一鈞說，JN.1變異株占比上升速度比預期慢，預估春節前才會超過EG.5，成為主流病毒株，而影響主要在春節之後。
黃立民推測，原因之一可能是多數人沒打XBB疫苗，導致EG.5變異株持續猖獗，病毒之間會互相競爭，後面的JN.1變異株就沒有優勢。傳播比較慢。
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