星期日有媒體爆出「請辭獲准」，陳吉仲8月底尚未萌生辭意，但隨砲火猛攻，為減少農業部被砲轟，他多次提出請辭，雖被挽留下來，他直言「抹黑有多可惡，要回應都要去找根據，字字斟酌，抹黑成本很低，隨便寫一個，要選舉的民意代表又亂講，媒體又發酵，每一個澄清怎麼比的上抹黑造謠的速度」。
包含50萬資本、圖利超市等議題，而農業部收集證據有時候要去調，要請業者配合才能呈現，當拿出證據後，就轉移議題、轉移戰場，打擊力道越來越大，這也讓他體驗到，台灣是一個民主自由的國家，每個人都有自由，但是面對這樣排山倒海抹黑的狀況，真的要有可以因應跟解決的方式，否則「專業」不見了就很麻煩。
最後還是要堅持離開的理由，就是因為如果沒有他請辭，農業部大概會因為他個人的因素被定型化，剛好搭配議題太容易被攻擊，所以真的感謝最後總統、院長願意讓我走。
週日「請辭獲准」消息傳出，傳言是派系鬥爭，陳吉仲不這麼認為，他沒有任何黨派，像是有同仁傳給他訊息，他才知道說，「我怎麼今天被規劃為，比如說什麼新潮流，然後一下子又被規劃英系，開玩笑，我都跟每個農業縣委員很好，我自己沒有派系，而且我也不是民進黨黨員，我無黨無派」。
他認為這個跟派系一點關係都沒有，「我做人都要考慮別人」如果在這個位置，我就會很害羞，他坦白，在年初缺蛋的時候，他「非常難受，那一陣子很難受、很難受，而陳院長又很溫柔，我更難受，陳院長沒有跟我講過一句因為缺蛋的責罵，他只請我趕緊解決」。
陳吉仲直言，2、3月是最難受的，跟現在一樣，因為我沒有把缺蛋解決，我無法接受自己沒有做好，影響到其他人，那時候院長才剛上來，立法院也都問他很多缺蛋問題，他真的非常難受，只因他認為「我給人家影響到了，那我怎麼有那個臉還在那裡」在3月及4月開會討論的時候有講過請辭，可是那時候沒辦法走。
隨缺蛋問題解決，現在也不是政策面的問題，是事情可以檢討的，因為蛋都進來，後面也都已經有長約、短約的制度在運作，現在是他個人影響到其他人，因此他辭意堅定。
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