「台北市淨零排放管理自治條例」是柯文哲前市長任內提出之重要法案，於111年3月9日送議會審查，經過7次分組審查會議後，通過7章51條的條文，並在6月22日由大會三讀通過，北市府於7月5日函報行政院，經過了3個月後，10月6日函請市府就各部會相關意見補充說明，市府在10月17日函後說明，但中央未回覆也未予核定。
蔣市府上任後，在今年3月22日函詢行政院進度，行政院於5月24日自次函請市府依行政院有關機關意見重新檢視此自治條例法，並就是否牴觸112年2月15日修正公布之「氣候變遷因應法」及相關法規規定補充說明。北市府6月26日在函後行政院，就中央之意見提出說明；通過至今已於一年兩個月仍未獲中央核定，因此也讓此法無法施行。
行政院5月24日發文給市府要求重新檢視該自治條例，及北市府6月26日由法務局代決行回覆行政院之主要爭點包括：
1.中央認為北市自治條例第10條及第10條第1項，疑有牴觸氣候法第24條，因為「溫室氣體增量抵換相關事項，屬中央權責上」，北市府回覆，本自治條例在「氣候變遷因應法」(氣候法)未修正公布前，即以依「行政院環保署審查開發行為溫室氣體排放量增量抵換處理原則」辦理，考量各縣市溫室氣體測量之重點對象不同，宜有地方政府因地制宜之管制作法。」
2.中央認為北市自治條例第13條有牴觸氣候法第21、28、29及34條至第36條，溫室氣體排放管制、碳費徵收制度、超額交易、改善期限等，這些規定規定屬中央權限；北市府則回覆：環境基本法第25條第2項規定，地方政府得訂定較中央嚴格之管制標準，北市府規範之對象為溫室氣體年排放量達8000公噸CO2e以上之相關單位，約75家，並未與中央規劃納管徵收之287家排碳大戶名單重疊，不會有重複納管之情形，而且北市規定之溫室氣體排放量超標，得交易或供其他列管對象抵換，可具體推動事業自願減量，並未牴觸氣候法相關規定。
3.中央認為本自治條例第39、51條第一項第14款及第12項違反第39條第12項最長改善期限之規定，有牴觸憲法第108條第1項第3款「商業」及證交法之疑慮；市府則回覆：本條例要求一定條件之公司應揭露氣象相關資訊，及定期辦理風險管理人員訓練，並無與中央法令競合或牴觸。
台北市議員秦慧珠認為，台北市去年在中央無作為未修訂「氣候變遷因應法」之前，就率先訂定「淨零排放管理自治條例」，所訂法規內容比中央更明確、更周延、更嚴格，中央卻來杯葛，以並不完備的中央法規「卡」台北市自治條例，讓這部領先進步、立意良善的法規延宕一年多仍未獲中央核定，實為少見，希望新成立的「環境部」可以正視此案，盡速核定，勿再拖延。
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