高端公司開發的新冠肺炎疫苗在疫情間因捲入緊急授權圖利爭議、雖與世界衛生組織（WHO）合作進行第三期臨床試驗，但至今並無結果報告，指揮中心後續也決定不持續採購，不過衛福部傳染病防治諮詢會預防接種組（ACIP）召集人李秉穎今在電台節目無奈表示，高端與WHO其實簽了「不平等條約」、被要求不能過問研究內容，因此有點被耍了的感覺。
李秉穎指出，在這次疫情間，傳統疫苗大廠循著傳統的疫苗開發流程進行、因此發展速度較為緩慢，反而是莫德納、BNT躍升成世界十大疫苗，緊急疫情下需要的應是可塑性、可改變性，不必拘泥於嚴格條文，如果有跟大廠合作的話，相信高端這段開發路不會這麼辛苦。
然而，高端公司近期陸續取得流感疫苗、腸病毒71型疫苗的常規藥證，近期也將加入疾管署公費流感招標，然有立委質疑，高端疫苗今年3月合併營收連續3個月掛零，邀請高端參與招標形同「及時救援」，但疾管署昨晚聲明強調，相關採購程序皆依政府採購法規定，今年度公費流感疫苗採購案以「限制性招標」適用「最有利標」方式辦理，領有流感疫苗許可證之廠商，可提出供應計畫及報價。
李秉穎表示，腸病毒71型疫苗是高端公司執行多年的項目，在越南、台灣都有做第三期臨床試驗，不過都都還在燒錢階段，因此沒有產品上市，而當初高端開發新冠肺炎疫苗、參與審核時，雖然還沒有疫苗上市，但不會因此就排除其資格，不能說這間公司以前都沒有產品，專家會議就不審，且過去國外也有很多疫苗設計失敗的案例，比如中國的疫苗，雖效果得到WHO認可，但學術文獻都指出其效果是目前上市疫苗中最差的。
針對一系列高端疫苗風波，李秉穎表示，台灣有必要就整個新冠肺炎疫情進行回顧，並思考如何客觀看待國產疫苗，當年H1N1疫情爆發時，國光疫苗也曾經被各界質疑、指責，未來應避免要讓政治力影響國產疫苗，否則以後台灣恐需完全依靠國外疫苗，時序上將受到影響，因此如何看待國產疫苗是非常需要去仔細討論的事情。
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