知名降血脂用藥「立普妥膜衣錠10毫克」日前傳出缺藥，食藥署也予以證實，並強調國內有學名藥可替代，民眾不必過度擔憂，但醫師認為民可能用不慣、還是會想用原廠藥，對此薛瑞元3/13直言，「這種話是有待斟酌」，醫界人士這麼說並不妥當，因為所有學名藥都通過相關試驗，成效和原廠藥一樣，「說用不慣這是一個迷思、此風不可長」。
北市聯醫胸腔內科醫師蘇一峰日前透過臉書表示，學名藥與原廠藥並非沒差別，台灣去年的本土研究蒐集8家醫學中心的大白肺病人來分析，結果發現使用原廠抗生素的治療成功率是學名藥抗生素的3.77倍，死亡風險為0.27倍。
對於醫師的質疑，薛瑞元今出席立院衛環委員會前接受媒體聯訪時再度強調，學名藥上市也有受到食藥署把關，經過藥品生體可用率及生體相等性試驗（BABE）後，其效果應是可匹配的，至於實際上使用是否真的有差距，要看證據，該位醫師提出的當然是證據之一，但目前還沒檢視其研究方法，且該位醫師提出的案例為抗生素，問題比較複雜，會牽涉到抗藥性問題。
薛瑞元進一步解釋，原廠藥都還在專利保護期間，學名藥還沒問世，但持續使用下，可能已經慢慢出現抗藥性問題，所以等學名藥出來時，抗藥性可能已經出來、效果自然也打折扣，但實際情況還需要科學證明，「說原廠藥一定比學名藥好，這樣講是不太妥當的。」
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