針對舍利子成因，長庚醫院腎臟科主治醫師田亞中表示，目前科學上對於「舍利子」的成因還沒有定論，也沒有經驗證正確的解釋，但有部分認為，舍利子其實是身體裡面的結石，比如腎結石、膽結石、痛風石等都有可能，或是體內軟組織鈣化的結果，而軟組織鈣化不一定與疾病有關，可能是身體自然老化造成，屬於機率性問題，骨骼本身在火化時遇熱，也可能發生組成變化。
但田亞中強調，前述說法仍屬推測階段，科學上還要有更嚴謹的檢驗才能確認，比如透過X光繞射等，了解其成分與結構，並釐清不同顏色的舍利子，是否是因為其成分不同所致，不過相關研究也很有限，目前還沒有真正的科學解釋。
林口長庚醫院副院長、林口長庚醫院泌尿科主治醫師馮思中則表示，學術界認知的結石與宗教界講的「舍利子」是否是相同的東西並不確定，但軟組織有時候會鈣化、老化，產生像石頭一樣的物質，以泌尿科來說，如果長在腎臟、膀胱，就要儘快處理，若長在骨盆腔、淋巴、軟組織鈣化，沒有特別症狀，臨床上也不會特別治療，是否會在人過世後成為所謂「舍利子」，就無法確認了。
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