指揮中心發言人莊人祥表示，近期機場每天約1000多人入境，而小三通頂多100多人，加上旅客來源地的疫情差異，部分已開始慢慢降溫，在陽性率上會有差異，整體來說，1/1至1/9期間，自中國入境台灣總人數共11,445人，其中2,034人唾液PCR陽性，陽性率17.8%。
莊人祥進一步指出，馬祖旅客至今唾液PCR陽性人數一直是零，可能代表相關地區比較沒有被感染，而金門旅客主要來自廈門，該地區近期的新冠肺炎盛行率約18%左右，兩者數值相近，但僅有不到1/3的陽性者是Ct值低於27的個案，相關檢疫只能代表過去感染的程度。
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