台北市醫師公會常務理事洪德仁說，他在今年5/19確診，符合新冠肺炎口服抗病毒藥物用藥條件，看診醫師也為他開立倍拉維的處方，但藥物僅儲放在核心藥局、全台北市也才兩家，他家住北投，家人為了幫他領藥，要一路跑到士林區，堪稱「天才的給藥機制」，政府一直說藥足夠，卻沒想到民眾不一定拿得到。
基層醫療協會秘書長羅源彰進一步批評，抗病毒藥的發放流程有嚴重瑕疵，目前新冠肺炎口服抗病毒藥物有倍拉維、莫納皮拉韋等兩種，前者效果較好、但禁忌症與交互作用眾多，後者效果較差，但若病患不適合使用倍拉維，就有可能使用到，但不是每間診所都有備藥，需要到核心藥局或其他有備藥的醫療單位領取，才能提供給病患。
針對莫納皮拉韋的用藥情況，羅源彰說，診所處理60到70%的新冠確診病患，每天上午、下午都可能碰到需要使用莫納皮拉韋的病患，卻因為沒有被配送此種藥物，看診完、開完處方，都要讓病患「等一下」，診所醫事人員要先到核心藥局拿藥，再打電話跟病患說「藥來了」，來一個病患就要做一次，一來一回花費很多時間，次數一多，醫療人員也會感到累。
因此，羅源彰說，基層醫療協會曾兩度發文、建請衛福部調整基層診所口服抗病毒藥物莫納皮拉韋的配置，但中央流行疫情指揮中心兩度以「莫納皮拉韋非首選藥物」，是提供給血液透析、思覺失調等病患為主拒絕，最後變成「3輸」局面，醫事人員覺得「算了」，不開省得麻煩，讓病患先觀察看看、變嚴重再說，莫納皮拉韋使用率偏低不是沒有原因的。
另有多位專家與醫事團體代表對基層藥物配置提出質疑，對此薛瑞元回應，他代表衛福部感謝第一線醫護人員努力，但今年開始因應Omicron疫情採取輕重分流、9成以上病患由基層照顧，這樣的模式並沒有錯，請不要輕易攻擊這樣的做法，針對醫師公會代表提出莫納皮拉韋問題，會檢討改進、讓藥更容易取得。
薛瑞元解釋，過去看的是日本經驗，兩種藥進來，莫納皮拉韋因為處方禁忌少，日本經驗中反而用比較多，但莫納皮拉韋效果比不上倍拉維，基於擔心民眾沒用到比較有效的藥，所以在量上面做了控制，現在基層或是醫院都已經非常充分瞭解這些藥物使用方法，也認為應該要尊重醫師的臨床判斷，「可以承諾莫納皮拉韋的配賦與使用（流程）會放寬。」
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